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第二军医大Nature子刊发表lncRNA新发现

2016.11.08

  长非编码RNA(lncRNA)是一些长度超过二百个核苷酸的RNA分子,来自于基因组的非编码区域。虽然lncRNA没有编码任何蛋白质,但它们在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性,这说明lncRNA具有重要的生物学意义。

  在测序技术的帮助下人们已经发现了数千种lncRNA,但这些lncRNA的生物学功能依然还是个谜。第二军医大学的研究人员在Nature Communications杂志上发表文章,揭示了一种lncRNA控制人胚胎干细胞(hESC)自我更新的分子机制。文章通讯作者是第二军医大学的刘厚奇(Houqi Liu)教授和Yue Wang。

  生长停滞特异性转录本5(GAS5)是一种与生长停滞有关的lncRNA,也是已知的肿瘤抑制者。研究人员发现,GAS5在hESC中高水平表达,并且被多能性因子OCT4和SOX2直接调控。研究显示, GAS5敲低会严重损害hESC的自我更新,过表达则会显著促进hESC自我更新。进一步研究表明,GAS5能保护NODAL使其免于降解,由此维持NODAL信号传导。

  研究指出,上述多能性因子、GAS5和NODAL形成了一个维持hESC自我更新的前馈信号回路。鉴于GAS5的这种调控功能具有干细胞特异性,研究人员提出lncRNA的功能可能在不同类型细胞中是不一样的。

  人们发现,有些lncRNA通过RNA-蛋白互作招募调控复合物,进而影响附近基因的表达。可能正是因为这个原因,lncRNA表达往往与附近基因的表达相关。不过,这种关联分析起来并不容易。Broad研究所的科学家们最近在这方面取得了重要成果。他们在Nature杂志上发表文章揭示了lncRNA对基因表达的本地调控机制。

  中科院生物物理所的科学家们对肝癌进行深入研究,鉴定了一种支持肝癌干细胞自我更新的lncRNA(lnc-β-Catm)。这项重要研究成果于五月三十日发表在Nature Structural & Molecular Biology杂志上,文章通讯作者是中科院生物物理所的范祖森(Zusen Fan)研究员。

  中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所的研究团队鉴定了一种源自多顺反子转录本的lncRNA。他们在Molecular Cell杂志上发表文章指出,一种不寻常的加工机制会生成能隔离多个RNA结合蛋白的SPA LncRNA。

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