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1月27日《自然》杂志精选

封面故事:东南亚猩猩基因组完成测序

  东南亚类人猿或猩猩的基因组已完成测序——具体来说,所获得的是一个苏门答腊雌性个体的基因组初稿以及来自另外5个苏门答腊猩猩和5个婆罗洲猩猩(分别是Pongo abelii和Pongo pygmaeus)的短序列数据。测序分析表明,婆罗洲—苏门答腊全基因组核苷酸身份平均符合度为99.68%,这种很大的差异性反映了两个岛屿种群截然不同的演化史。由于两个猩猩种群都属于濒危物种,所以本文作者们希望,有关基因组序列及其在种群之间的差异的知识将会为保护工作者提供有价值的资源。

非转录机制在生物节律中所起作用

  生物钟是生理和行为的关键计时调控因子,在真核生物中普遍存在。关于生物钟的大多数机制模型都是基于转录周期,但关于转录后调控的证据最近已在植物和蓝细菌中找到。现在,两个小组介绍了“peroxiredoxin蛋白”(过氧化物氧还蛋白)的氧化在维持人血红细胞单细胞藻类绿藻(Ostreococcus tauri)中的节奏可控的振荡中所扮演的一个角色。这些数据反映了非转录机制在生物钟模型中所起的一个作用,也为未来探讨转录和非转录节律机制之间的联系开启了大门。

融水的产生会降低冰川移动速度

  人们也许以为,在气温较高年份所增加的融水会在移动的冰川或冰层与下面的基岩之间起润滑作用,从而加快冰体移动的速度。但事实显然不是这样的。现在,关于格陵兰冰体移动速度的卫星观测数据,为最近的一个理论预测提供了经验支持。该预测是,与高融水输入相关的高效冰下水系的发育事实上会降低冰的移动速度。来自“格陵兰冰层”上六大冰川的数据表明,虽然最初的冰移动速度的加速在这项研究工作的全部六年中都是相似的,但在温暖年份、当有更多融水产生时,冰川移动速度在晚夏时急剧减慢。

等位基因的不平等表达对社会行为的影响

  “遗传印记”(某一亲代等位基因的优先表达)一般被认为是发育过程中的一个影响因子,但一个等位基因的不平等表达是否会影响社会行为以前却没有得到研究。衔接蛋白Grb10在胚胎形成过程中主要由母方等位基因表达。这里,Andrew Ward及其同事发现,在胎儿生命形成之后,Grb10主要由大脑中的父方等位基因表达,消除这种等位基因偏向会诱导社会行为发生改变。这是有关某一“印记基因”(imprinted gene)的每个亲代等位基因的组织特异性动作会影响截然不同的生理或行为过程的第一个研究报告

第二个诱导肾癌的基因被发现

  利用大规模“外显子组”测序,Andrew Futreal及其同事在“透明肾细胞癌”(最常见的肾癌类型)中发现了第二个经常发生突变的基因(第一个为VHL)。PBRM1(转录调控中所涉及的SWI/SNF复合物的一个成员)在约40%的病例中发生突变,被发现发挥肿瘤抑制基因的功能。过去,在一项与本研究无关的小鼠转位子筛选研究中,PBRM1曾被发现是胰腺癌中一个假定存在的癌症基因。这些结果,再加上同一复合物的其他成分为已知癌症基因这样一个事实,将PBRM1明确地认定为一个主要癌症基因。

引导RNA的目标识别
 

  一些RNA(被称为引导RNA)利用它们编码的序列信息来帮助将一个蛋白引导到它应该去的地方。这些RNA-蛋白(RNP)复合物中的一种(被称为box C/D RNP)催化有一个“2′-O-甲基化官能团”的RNA的地点特异性修饰。现在,完整box C/D RNP复合物(包括三个蛋白亚单元、引导RNA和两个基质RNA中的任意一个)的结构已被确定。该结构显示了引导RNA和目标RNA是怎样排列的、以及甲基转移酶亚单元“纤维蛋白”(fibrillarin)是怎样帮助将目标核糖定位到活性点内的。

OGT的二元及三元复合物的结构被确定

  “O-GlcNAc转移酶”(OGT)是哺乳动物的一种必要的酶,起营养物传感器的作用。它使带“O-linked β-N-acetylglucosamine (O-GlcNAc)”的蛋白发生糖基化,这种作用调控各种不同的细胞信号通道。Suzanne Walker及其同事介绍了人OGT与UDP形成的二元复合物的晶体结构以及与UDP和一个肽基质形成的三元复合物的晶体结构。这些结构显示了OGT是怎样识别肽序列的,也提供了关于在包括糖尿病、癌症和阿尔茨海默氏症等在内的若干人类疾病中以异常形式被发现的一种酶的作用机制的信息。

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