【求助】HindIII的保护碱基

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RT,我现在在设计引物,往酶切位点外面加入保护碱基,但是HindIII的保护碱基就不知道加几个了,我们实验室的人说几个都可以,但是我看TAKARA的书上说3个CCC保护碱基时,才有酶切效果,我现在很是混乱。想问问,
1、HindIII的保护碱基到底加几个?
2、如果是三个的话,一定要是CCC吗?
3、加入保护碱基,是AT还是CG?需要考虑整个酶切位点的引物的GC含量吗?

谢谢啦,我现在比较急
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最新回复

  • okhaha (2015-3-11 16:33:51)

    有takara的产品目录可以参考一下,
    一般的酶切位点加三个碱基就都没问题了,保护碱基最好用GC,不用AT,稳定一些
    我没考虑过GC含量之类的,只要别是很多个G或C连起来就行
  • sr9971 (2015-3-11 16:49:28)

    保护碱基可以随便加,只要和你的模板匹配上,符合引物设计的原则既可!没有必要去较真!
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