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专家们告诉你,他们如何保存样品?

2015.3.11

  假如说有天你正在构建实验室需要的遗传材料,刚刚完成了一些纯化插入片段,PCR产物,和半成品质粒,这时候突然有事需要你去处理,你只好赶紧把这些东西放到-20°C 的冰箱里,但是却忘了在笔记本上记录下它们的位置。之后你的同事想要继续完成这项工作,但他们不知道到哪里去找样品,你一时半会也回不来,那么怎么办?

  在生物实验室经常有人说,我们最重要,最宝贵的资产就是冰箱里或者液氮罐里Eppendorf管里保存的东西了,但是在这些容器上要标注出处,用途,来源,时间等大量信息并不容易,而且还要考虑到某些人的潇(ma)洒(hu)字迹。更别提经年累月后,几经易手后,令人费解的一连串神秘的字母和数字,如SHC1-1 标识的是什么意思?那是一个质粒,还是引物?全长的还是部分片段?浓度是多少?在这种情况下,研究人员通常别无选择,只能抛弃这一也许具有重要价值的样品。

  这种情况也许在每个实验室中不可避免,就算是进行了细致的文档记录,但是项目一旦完成,也许就不会再有人记起这些样品了。The Scientist杂志近期汇总了一下专家的意见,看看他们的实验室是如何保存样品的呢?

  第一个例子:来自波士顿儿童医院的George Daley实验室

  George Daley教授是干细胞领域的著名学者,多年来从事多能干细胞维持全能性的分子机制研究,在多能干细胞向造血细胞分化等领域都作出了重要贡献,其实验室是最早建立人iPS细胞及病人来源iPS细胞的实验室之一,Daley教授也曾于2007年担任国际干细胞学会的主席。

  主要问题:

  Daley 教授实验室在同一时期有20-40名实验室工作人员同时工作,他们都需要用到三台–80°C 冰箱和两个液氮罐,这会导致产生大量需要保存的试管,容易丢失或错位。

  解决方案:

  经过多年的实验研究,Daley实验室出现了无数需要保存的细胞株和试剂。2007年,实验室管理员Beth Kaleta加入他们实验室,当时寻找样品的唯一方法就是在一个留有各种涂鸦,“鬼画符”的活页夹上寻找试剂样品的踪迹。

  为此Kaleta构建了一个Excel 电子表格来追踪出处,比如说她记录下A质粒位于冰箱3层、2排、第四个盒子的D2位置,从此之后每一位研究者都这样保存他们的样品。“这个编撰目录并不容易,因为有时样品并不能与实验室笔记相匹配,所以我们也在考虑加上条形码。”

  实验室里的每位博士后都至少有一个液氮罐架子(5个盒子,每个盒子有81个样品),以及超低温冰箱中的架子(16个盒子)。在实验室中,研究人员自己负责自己的材料,但是一旦这位研究人员不在,那么“我们就无法知道他盒子里留下了什么”,Kaleta说。

  每当有人离开实验室,Kaleta就会与另外一位资深研究员,和这个要离开的研究人员进行交接,确保关键的试剂和细胞株不会丢失。她表示,关键的细胞株会被送到哈佛干细胞研究所核心实验室中进行扩增和保存,重要的质粒也会被保存,并转移到

   Addgene,这是一个非盈利性质的生物试剂存储库和分配库,目前已有75个Daley 实验室的质粒可以提供给全球2,000个实验室使用。

  一般来说,Daley 实验室自己只会保存两小瓶,“这样就能腾出许多空间来,”Kaleta说。

  从笔记本到电子表格,Kaleta进一步完善了实验室的保存样品管理,但是依然还是会出现无法识别的样品,她说,像之前有位博士后,他设计了多个iPSC细胞系,并用一个只有他自己知道的密码方法进行命名,现在自己却忘了。

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