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Cell解析重要的转录复合物

2014.6.06

  中介体复合物(Mediator Complex)是细胞中最大也最为复杂的分子机器之一。日前,Scripps研究所(TSRI)的科学家们用电镜获得了首个中介体复合物(Mediator)的精确结构图,这一成果发表在六月五日Cell杂志上。

  Mediator是所有动植物细胞中的关键分子机器,对于绝大多数基因的转录有着至关重要的调控作用。Mediator拥有二十多个蛋白亚基,解析它的结构是基础细胞生物学的一大进步。这一成果能够为许多疾病提供宝贵的线索(从癌症到遗传性的发育疾病)。

  “明确这些大分子机器的结构和作用机制,可以帮助我们理解许多关键的细胞过程,”文章的资深作者,TSRI的副教授Francisco J. Asturias说。

  复杂的分子机器

  大约二十年前,诺贝尔奖获得者斯坦福大学的生物学家Roger Kornberg在首次发现了Mediator,当时Asturias是他实验室中的一员。

  每个细胞都有自己的基因转录模式,这种模式受到细胞的严格控制。Mediator在基因的转录调控中具有不可替代的“桥梁”作用。转录因子和其他调控蛋白通过巨大的Mediator,对执行转录的RNA聚合酶II施加影响。

  要阐明Mediator的具体作用机制,就需要了解它的精确3D结构,明确所有亚基的定位和复合物的不同构象。问题是Mediator不仅大,而且高度复杂,灵活性也很强,导致人们很难对其进行高分辨率成像(X射线晶体衍射或核磁共振光谱法)。

  1999年,Asturias及其同事曾利用早期的单颗粒电镜技术,获得了完整Mediator的粗略结构,当时这项成果发表在Science杂志上。然而,在那之后人们一直未能获得清晰的Mediator结构图。

  颠覆旧模型

  在这项新研究中,Asturias等人获得了高纯度的酵母Mediator,并通过电镜成像得到了迄今为止最为清晰的Mediator 3D模型,分辨率达到约18埃。

  随后研究人员又进行了多种生化分析,例如在逐个去除蛋白亚基的同时观察电镜图像发生的改变。他们由此确定了酵母Mediator 25个蛋白亚基的精确定位。

  这项新研究获得的结构图谱,全面修正了之前的Mediator'粗略模型。“定位了所有的蛋白亚基之后,我们发现头部模块应该位于Mediator的顶部而不是底部,”文章的第一作者Kuang-Lei Tsai说。

  此外,研究人员还对人类Mediator进行了深入研究。“大体上看,人类和酵母的Mediator总体结构颇为类似,”Tsai说。最后研究人员在结构数据的基础上,为人们展示了Mediator调控转录时的构象变化。

  “我们希望能够更好的理解,Mediator与其它蛋白进行互作的具体过程,” Asturias说。

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