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Nucleic Acids Research发布最全面的microRNA数据库

2014.8.07

  基因是蛋白质的蓝图,而microRNA可以帮助细胞决定是否要根据这些蓝图制造蛋白。研究者们常常会面临这样的问题:某个与疾病有关的基因受到哪些microRNA的调控?或者,患者体内发现的某种microRNA负责调控什么基因?这些问题的答案,可以帮助医生和研究者们操纵机体中的致病蛋白水平(尤其是癌症)。

  日前,美国科罗拉多大学癌症中心在Nucleic Acids Research杂志上发布了一个被称为multiMiR的数据库,这个目前最全面的数据库广泛收集了microRNA及其作用靶标的信息。

  “数据库multiMiR可以让研究者们有效搜索,与疾病有关的microRNA-基因配对关系,”文章的一位资深作者,科罗拉多大学的副教授Katerina Kechris介绍道。

  除了为人们展示microRNA与其作用靶标之间的关系,该数据库还涵盖了能够影响microRNA的已知药物,列出了与microRNA有关的各种疾病。

  “现在,研究者们可以在这一数据库中寻找线索,为包括癌症在内的各种疾病开发新的治疗方式,”文章的另一位资深作者,科罗拉多大学的Dan Theodorescu教授说。

  据称multiMiR数据库整合了14个现存的microRNA数据库,并且关联了与这些microRNA有关的研究结果,允许研究者们进行更加灵活的数据分析。

  在使用这一数据库时,用户可以输入microRNA、基因、药物、疾病的名称,或者它们的任意组合。举例来说,multiMiR数据库可以根据用户输入的microRNA,搜索已验证或预测性的作用靶标。也可以根据用户指定的基因,给出已验证或预测性的调控microRNA。对于特定疾病和药物来说也是一样,该数据库可以告诉你哪些疾病和药物与你的microRNA有关。

  这篇文章举出了一些数据库的应用案例,包括分析microRNA对小鼠自发饮酒的潜在影响,研究慢性阻塞性肺病相关信号通路中的候选基因,以及能够影响膀胱癌的microRNA:基因互作。

  “我们需要通过更好的途径来分析已经获得的数据,不然就会迷失在信息的汪洋大海里,” Theodorescu说。“这项研究中的新工具能够为研究者们提供更有意义的结果,最终帮助人们开发出新的疾病治疗策略。”

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