【求助】Tricine-SDS-PAGE跑不动,而且溴芬兰变黄!


各位战友,最近实验遇到了困难,7kD多肽要用电泳检测,师兄说检测小肽要用Tricine-SDS-PAGE,可是我做了一个多月了,一直都没摸索好条件,主要问题是:
1. 跑不动(电泳2h溴芬兰才刚刚进入分离胶,继续电泳4h溴芬兰才到分离胶中间的位置)
2. 溴芬兰进入分离胶后约2h开始变黄
看了以前的帖子,分析原因可能是电泳缓冲液、凝胶缓冲液和上样缓冲液的pH不对,所以全部重新配的,而且全部一次性,没有重复利用,电泳时正负极间有气泡,说明电路的是通的(不过槽比较旧,接触不良,用皮筋儿勒住上盖就没事了),制胶用的胶条也撕掉了,这个因素也排除,我经验有限,实在找不出问题在哪。
为了让大家帮我分析原因,我把我的溶液配置、实验方法和电泳图发上来
1. 30%丙烯酰胺溶液
2. 凝胶缓冲液
三羟甲基氨基甲烷(Tris)    36.3g
SDS        0.3g
溶于80ml水,盐酸调pH至8.45,定容至100ml。2~8℃保存,3个月内使用。
3. 正极缓冲液
三羟甲基氨基甲烷(Tris)    24.4g
溶于800ml水后,盐酸调pH至8.9,定容至1000ml。4℃保存。
4. 负极缓冲液
三羟甲基氨基甲烷(Tris)    12.2g
SDS        1.0g
Tricine        17.9g
溶于800ml水后,盐酸调pH至8.25(未调时测pH为8.24),定容至1000ml。4℃保存。
7. 2×样品缓冲液(10ml)
浓缩胶缓冲液  0.48ml
80%甘油    5.0ml
10% SDS    0.8ml
1%溴酚蓝    0.2ml
1M DTT   2ml
水    1.4ml
制胶:
16%分离胶:(6ml)
30%丙烯酰胺溶液    6.4ml
凝胶缓冲液    4.0ml
甘油      1.6ml
10%过硫酸铵    60ul
TEMED      6ul
4%浓缩胶:(5ml)
30%丙烯酰胺溶液    0.67ml
凝胶缓冲液    1.67ml
水      2.50ml
10%过硫酸铵    50ul
TEMED      5ul
点样:以10ul/孔
程序1:恒压40v,至进入分离胶(约2.5h)
程序2:恒压100v(跑至分离胶一半约用4h)
固定,染色,脱色(这三步应该没问题)
请大家帮帮我~这步电泳对我的实验和毕业都非常重要~~~


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最新回复

  • fsdd817 (2014-3-27 22:33:27)


    1 上样量太多。减少到1/5-1/10试试看。
    2 电泳好像没有什么问题。tricine胶是要跑得慢一些,且胶浓度也大。你电压太低,自然跑得慢。如果玻板不会裂,可以直接100V电泳。我用北京六一的电泳槽(约8×10cm),都直接150 V。
    3 溴酚蓝变黄,是因为pH低的原因。只要电泳分离好,影响不大的。
  • tuuu2 (2014-3-27 22:33:51)

    1. 30%丙烯酰胺溶液
    改为49.5%(Acr48.0g,Bis1.5g)
    4. 负极缓冲液
    三羟甲基氨基甲烷(Tris) 12.2g
    SDS 1.0g
    Tricine 17.9g
    溶于800ml水后,盐酸调pH至8.25(未调时测pH为8.24),定容至1000ml。4℃
    保存。
    这个不用调pH配制后应该在8.3左右。
    7. 2×样品缓冲液(10ml)
    可以配成4x的
    制胶:
    16%分离胶:(6ml)
    DDW 1.2ml
    49.5%丙烯酰胺溶液 2.0ml
    凝胶缓冲液 2.0ml
    甘油 0.8ml
    10%过硫酸铵 60ul
    TEMED 6ul
    点样:以10ul/孔(可以稀释2-5倍上样)
    程序1:恒压40v,至进入分离胶(约2.5h)
    程序2:恒压100v(跑至分离胶一半约用4h)
    电压太小了,蛋白容易分散。可以直接恒流20-30V(根据自己的电泳仪选择)
    固定,染色,脱色(这三步应该没问题)
    嗅酚蓝变黄是缓冲偏酸了。不知是否与你调了缓冲的pH有关
  • yjf1026 (2014-3-27 22:34:11)


    你的问题和有可能出在缓冲液上。如果PH没有调准,就会出现跑不动,发热量高的问题。
  • utt0989 (2014-3-27 22:34:31)

    样品中的氢离子浓度高了 修芬兰就会变黄的
  • gogo (2014-3-27 22:34:49)

    你的阳极buffer和阴极buffer互混啊,在电泳的过程中,做tricine电泳,要切记不能互混电极缓冲爷,你可把电泳内槽拿出来加入buffer,如果漏的话,则不行,一定要确保不漏才保证阳极buffer和阴极buffer不互混啊
  • duoduo (2014-3-27 22:35:17)

    样品中的氢离子浓度高了 修芬兰就会变黄的

    ===============================================================================================

    样品都是一样处理的,之间应该没有什么差别,而且都是在进入分离胶后才开始慢慢变黄,而且总是从中间向两周扩散呢?
  • duoduo (2014-3-27 22:36:11)

    你的阳极buffer和阴极buffer互混啊,在电泳的过程中,做tricine电泳,要切记不能互混电极缓冲爷,你可把电泳内槽拿出来加入buffer,如果漏的话,则不行,一定要确保不漏才保证阳极buffer和阴极buffer不互混啊

    ============================================================

    确实有点漏,不过漏得很慢。
    我的电泳是自始至终都跑的很慢,难道漏过去几滴就会有那么大的影响吗?
  • redbutterfly (2014-3-27 22:37:19)

    样品呈现酸性,当指示剂了,哈哈,
    重新配吧,我也范过同样的毛病
  • gogo (2014-3-27 22:37:42)

    漏的话,你的阴极和阳极缓冲液就混了,PH就不对了啊,这和一般的SDS-PAGE不一样,混了还能用啊.
    这个你看看,尽量不漏啊,其他的按照protocol来应该没问题的啊.
  • 7437654 (2014-3-27 22:38:04)


    样品都是一样处理的,之间应该没有什么差别,而且都是在进入分离胶后才开始慢慢变黄,而且总是从中间向两周扩散呢?
    -----------
    兩邊有加BUFFER嗎?不過如果10道全部滿的話,周邊是有點影響的
    看圖,和LS說的一樣,减少上樣量吧,一般MINI膠都是用30mg的上樣量