大化所蛋白质和RNA复合物相互作用合作研究取得新进展

2010-10-21 15:01 来源: 中国科学院
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  中科院大连化学物理研究所海洋生物产品工程组薛松研究员在其2008年非编码RNA如何帮助蛋白质寻找特异底物分子研究工作(Nature Structural & Molecular Biology)基础上,再次与合作者利用结构生物学手段,揭示了另一类非编码RNA及其相关蛋白质和RNA的复合物的三维晶体结构及其相互作用。科学家们对该复合体的组装和功能研究已经持续了十多年,这一结果被认为是在认识该复合物的组合方式和其修饰RNA甲基化机理方面迈出了一大步:可以看到在原子水平上向导RNA、底物RNA以及相关的三个蛋白质的相互作用。

  RNA分子不仅仅作为编码蛋白质的模板,许多不编码蛋白质的RNA在生命活动也有重要的功能。C/D RNA就是一类广泛存在于古细菌和真核生物中的非编码RNA,他们因为含有共同的保守序列模块C和D而得名。C/D RNA主要功能是指导RNA底物,如rRNA、snRNA和tRNA发生特定位点上核糖的甲基化。C/D RNA含有一段向导序列,这段序列通过和修饰位点两边的碱基序列互补配对而实现对底物的特异性选择。在古细菌中,C/D RNA与RNA结合蛋白L7Ae、骨架蛋白Nop5和甲基化酶fibrillarin三个蛋白质亚基组成RNA-蛋白质复合体,该复合物能对底物进行特异位点的甲基化修饰。这种甲基修饰化反应是细胞生命过程中必不可少的。

  该研究工作已发表在近期的Molecular Cell上(Molecular cell, 39(6), Issue 6, Pages 939-949)。