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Cell新文章:癌症全基因组测序

2012.9.13

  根据华盛顿大学医学院的一项新研究,具有吸烟史的肺癌患者相比于不吸烟的肺癌患者肿瘤中的遗传突变要多10倍。这一研究在线发表在9月13日的《细胞》(Cell)杂志上。

  论文的资深作者、华盛顿大学基因组研究所主任Richard K. Wilson 说:“吸烟者基因组具有比不吸烟的肺癌患者基因组更多的突变,我们中没有人对此感到惊讶。但令人吃惊的是看到10倍以上的突变,它强化了旧的讯息——不要抽烟。”

  总的来说,该分析确定了所有17名非小细胞肺癌患者中大约3,700个突变。12名患者有吸烟史,5人没有。在每位从不吸烟的患者体内,研究人员发现至少有一个突变基因可用当前市场上用于其他疾病或通过临床试验可获得的药物靶向。在所有患者中,他们确定了54种与现有药物相关的突变基因。

  文章的第一作者、肿瘤学家Ramaswamy Govindan在华盛顿大学和巴恩斯-犹太医院的塞特癌症中心从事患者治疗工作。Govindan说:“这些药物实际上是否会在具有这些DNA改变的患者体内起作用还需要加以研究。而像这样的论文为了解发生的事件打开了新的图景。现在我们需要做的就是深入研究,并通过研究来了解这些突变如何引起和促进了癌症,以及如何能够靶向它们进行治疗。”

  肺癌可分为两种类型小细胞肺癌和非小细胞肺癌,后者约占85%的病例。非小细胞肺癌进一步分为三类。当前的分析包括了其中两种:16名患者患有肺腺癌,一名患者大细胞癌。

  Govindan和 Wilson还涉及了一个更大型的基因组研究,178名患者患有第三种类型鳞状细胞癌,相关论文报道在《自然》(Nature)杂志上。该研究是癌症基因组图谱计划(The Cancer Genome Atlas project)的一个部分,该计划的目的旨在描述常见癌症的遗传学。

  Govindan说:“在未来一年左右的时间内,我们将研究近1000个肺癌患者的基因组。因此我们正在朝着正确的方向——向着侧重于患者癌症的特异分子生物学的未来临床试验前进。”

  事实上,根据例证不同癌症类型中常见突变新的遗传研究,Wilson推测该领域或许可以达到医生能够基于突变基因而非受累器官标记和治疗肿瘤的高点。例如,在突变基因驱动肿瘤生成后他们或许可以将之称为“EGFR癌症”而非“肺癌”。EGFR突变被发现存在于多种癌症中,包括肺癌、结肠癌和乳腺癌。

  Wilson说这种标记是有关系的,因为如今获得批准的靶向治疗是以患病器官或组织为基础。例如赫赛汀(Herceptin®)本质上是一种乳腺癌药物。但他看到肺癌转折具有Herceptin可以靶向的相同的基因突变。

  他说:“例如,如果基因组测序揭示一位肺癌患者具有一种突变,已知其对一种在具有相同遗传改变的乳腺肿瘤中起作用的药物敏感,你或许会想将这一药物用于这些肺癌患者,理论上是作为临床试验的一部分。在今后几年,我们希望更多的基于肿瘤改变的遗传构成而非起源组织来治疗癌症。”

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