ThermoFisher推出Proteome Discoverer蛋白质组学软件
Thermo Fisher推出Proteome Discoverer：前沿蛋白质组学研究的突破性生物软件
质量信息学平台提供了强大的分析、开放和灵活架构，易于使用的界面
2008年5月30日，圣何塞，服务科学，世界领先的赛默飞世尔科技公司，今天宣布将在ASMS 2008（第56届美国质谱大会）上，推出Proteome Discoverer，一款新的蛋白质组学分析软件平台，提供最全面的蛋白质组学定性定量数据查看。Proteome Discoverer使研究者可以在比以往更大的规模上，在一个程序里合并和比较从多个搜索引擎、公共数据库和裂解方法中获得的数据，并且易于使用、灵活。Proteome Discoverer强大的定量分析能力包括：工业标准级的最好实践，新的赛默飞世尔科技的解决方案，同位素标记技术，如iTRAQ™和TMT™。
科学家们已经花费了十年的时间来完善蛋白测序，但发现目前的软件产出的，仅是比一个定性数据列表多不了几个的结果。取代了赛默飞世尔科技BioWorks™的Proteome Discoverer，是第一个商用的蛋白质组学数据分析平台，使研究者们可以在一个程序中，合并、比较和分析从多个来源来的数据。
“今天的科学家们想要的，是比从他们的分析程序中的一个搜索引擎和一个蛋白序列多得多的结果，但是他们不想雇用一个完整的生物信息学团队去获得这些结果。”Andreas Huhmer，赛默飞世尔科技蛋白质组学市场总监说，“Proteome Discoverer是一套完全的流程解决方案，提供了功能性的一个层次，而迄今为止，达到这种层次要求一套复杂且昂贵的、客户自建的解决方案。我们的软件是一流的并且易于定制，因此研究者可以集中精力开展研究，而不用编程——科学不应该被软件所局限。”
Proteome Discoverer可分析从所有的赛默飞世尔科技的质谱仪上获得的数据，并兼容所有的标准蛋白质组学流程。它向上兼容使用BioWorks产生的数据，对现在的BioWorks用户，提供无缝的升级途径。Proteome Discoverer包括了SEQUEST检索算法的许可（license），而SEQUEST是确定性的蛋白鉴定的工业标准。
Proteome Discoverer是一个开放和灵活的平台，集成了新的工具，数据源和分析方法。
Proteome Discoverer一个主要的优点是从多种裂解方法中分析信息的能力，从而去发现更多的翻译后修饰（PTMs），并提高多肽和蛋白鉴定的准确度。比如，在单次操作中，CID（碰撞诱导解离）和ETD（电子转移解离）数据能被同时分析，提供结果的序列、翻译后修饰和交叉确认信息。并且，从赛默飞世尔科技专有的、Z-Core算法（该算法分析由ETD产生的C-离子和Z-离子谱图）中获得的信息，能和CID谱图数据合并检索，在一个简单易读的格式中提高蛋白的覆盖率（protein coverage）。
相似的，使用Proteome Discoverer的工作流程引擎，Proteome Discoverer使研究者可合并搜索引擎结果和公共数据库信息，提供交叉确认的多种方法。例如，从Mascot™和SEQUEST等不同的搜索引擎中获得的数据，可被合并入单个的报告中。其它的软件特征包括：错误发现速率的自动化计算，可允许比较数据库搜索引擎的结果。
Proteome Discoverer是一个开放的平台，和常用的生物信息学工具兼容，比如InforSense KDE环境；同时也支持人类蛋白质组学组织（HUPO）开发的所有数据标准，如ProtXML和mzML文件格式。一个新的开发包，会在今年晚些的时候发布，将使研究者可定制平台。
赛默飞世尔科技的Proteome Discoverer支持客户服务器端应用的版本已开始销售，具有灵活的授权模式和价格。关于Proteome Discoverer和赛默飞世尔科技产品的更多信息，请访问赛默飞世尔科技在第56届美国质谱大会（ASMS，丹佛， 6月1日至5日）的展台，展位号：booth 41。或者访问：www.thermo.com/proteomics
SEQUEST是美国华盛顿大学（University of Washington）的注册商标
Mascot是Matrix科技公司的商标
关于Thermo Fisher Scientific（赛默飞世尔科技，原热电公司）
Thermo Fisher Scientific(赛默飞世尔科技)（纽约证交所代码：TMO）是全球科学服务领域的领导者，致力于帮助客户使世界更健康、更清洁、更安全。公司年销售额超过100亿美元，拥有员工约33,000人，在全球范围内服务超过350,000家客户。主要客户类型包括：医药和生物公司，医院和临床诊断实验室，大学、科研院所和政府机构，以及环境与工业过程控制装备制造商等。公司借助于Thermo Scientific和Fisher Scientific这两个主要的品牌，帮助客户解决在分析化学领域从常规的测试到复杂的研发项目中所遇到的各种挑战。Thermo Scientific能够为客户提供一整套包括高端分析仪器、实验室装备、软件、服务、耗材和试剂在内的实验室综合解决方案。Fisher Scientific为卫生保健，科学研究，以及安全和教育领域的客户提供一系列的实验室装备、化学药品以及其他用品和服务。赛默飞世尔科技将努力为客户提供最为便捷的采购方案，为科研的飞速发展不断地改进工艺技术，提升客户价值，帮助股东提高收益，为员工创造良好的发展空间。欲获取更多信息，请浏览公司的网站：www.thermo.com.cn
