《PLOS Genetics》：追踪HIV在北美的进化轨迹
包括西蒙佛雷泽大学(SFU)研究人员在内的一项研究，追踪了HIV在北美的进化轨迹，他们发现证据表明，病毒随着时间的推移慢慢地适应其人类宿主。然而，这种变化是如此循序渐进，因此不可能对疫苗设计产生影响。
本研究第一作者、SFU健康科学学院助理教授Zabrina Brumme称：“许多研究都集中在HIV如何适应抗病毒药物，我们想了解的是，随着时间推移HIV如何适应我们人类宿主。”
这项研究发表在2014年4月24日的《PLOS Genetics》杂志，是由Brumme实验室与哥伦比亚大学HIV卓越中心的科学家合作带领，还包括哈佛大学、纽约血液中心和旧金山公共卫生部等机构。
Brumme称：“HIV以可再生的方式来适应免疫反应。理论上说，如果这种突变会在群体中传播，这对于宿主免疫力和疫苗来说，可能个坏消息。就像传播耐药性可以损害治疗成功一样，传播的免疫逃避突变也可以影响我们抗击HIV的自然能力。”
研究人员描述了从1979年(北美艾滋病开始流行)开始到现在的患者HIV序列。研究小组重建了传染病的祖先HIV序列，并从那里评估了免疫逃避突变在人群中的传播。
Brumme指出：“总的来说，我们的研究结果表明，病毒在北美适应的很慢。在世界HIV重灾区，适应率可能会更高。”
Brumme补充道，本研究以一个充满希望的消息结束，他说：“我们已经有工具，以治疗的形式来遏制HIV，我们将继续朝疫苗和治愈前进。总之，我们可以在病毒通过群体水平适应性对宿主免疫力破坏之前，阻止HIV。”
众多SFU研究人员参与了这项分析，需要从历史标本细致地恢复病毒RNA，然后进行实验室培养。从血浆或血清中提取HIV RNA，然后利用测序特异性引物和扩增子进行巢式RT-PCR，在3130xl和/或3730xl自动测序仪上进行测序。三个SFU毕业生，包括健康科学专业的Laura Cotton，是本研究的共同第一作者。
Cotton指出：“这是一项艰苦的工作，但是，了解到它们对我们大陆的HIV历史具有重要的作用，在实验室中研究这些菌株就非常的吸引人。”众多的本科生、研究生、博士后和教授包括客座教授Art Poon和副教授Mark Brockman也是共同作者。本研究，由加拿大卫生研究院(CIHR)和迈克尔史密斯卫生研究基金会(MSFHR)资助。
