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赛默飞世尔科技推出新的蛋白质组学解决方案

2008.8.21

        2008年8月18日,服务科技,世界领先的赛默飞世尔科技在2008年人类蛋白质组大会(HUPO 2008)上,推出新的蛋白质组学工作流程解决方案,以及两个Thermo Scientific软件升级包。不久前推出的Proteome Discoverer 软件平台是一个综合性的、可拓展软件平台,可以对蛋白质组的数据进行定性和定量分析,作为Proteome Discoverer 的补充,新加入的部分将进一步提升赛默飞世尔科技的Proteome Dynamics(蛋白质组动力学)产品。

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        Proteome Dynamics是一套完整的蛋白质组解决方案,包括试剂、样品制备试剂盒及操作流程、质谱仪和具有特定功能的生物软件,以方便鉴定、定量和表征蛋白质。推出新品包括以下几个方面:

  • 自动化的磷酸化肽段工作流程:一套完整的、自动化分析磷酸化肽段的操作流程
  • SIEVE™ 1.2:对SIEVE软件做了较大升级,SIEVE是无标记差异分析软件,通过比较LC/MS数据组,来测量和鉴定蛋白和肽段的变化。
  • ProSightPC™ 2.0:拓展了业界领先的自上而下(top-down)鉴定软件——ProSightPC的能力,现在支持所有高质量准确度的串联质谱实验,进行蛋白鉴定和表征。

       在过去的十年里,蛋白质组学领域大步发展,它对生物和医药领域的尖端科技产生了深远的影响。Thermo Fisher一直致力于蛋白质组科学的发展,打破了传统的蛋白质组定性分析和先进的蛋白质组定量分析之间的边界,因而创建了蛋白质组的动态图像。

       新型自动化磷酸化肽段分析流程将Thermo Scientific技术与Pierce®磷酸化肽段富集试剂盒、Kingfisher® Flex 磁珠纯化系统和LTQ Orbitrap™ XL ETD 杂交质谱仪结合起来,可实现全自动的磷酸化肽段分析。致力于描绘信号传输路径图的科学家已发现,先用固定化金属和金属氧化物的亲和色谱(IMAC)富集磷酸化肽段,再进行质谱分析是一种功能强大的技术。然而,样品的复杂度和制备步骤的通量低,成为一个主要的障碍。新型Thermo Scientific的整合操作流程对这类难题提供了一个简单可靠的解决方案。“样品制备和分析过程的每一步都是经过优化的。”Thermo Fisher Scientific 蛋白质学市场总监Andreas Huhmer说,“该工作流程可以使科学家实现整个过程无缝连接。”

         在HUPO2008上发布的另一款软件是Thermo Scientific 的SIEVE 1.2。通过比较“健康的”(或受控的)和“疾病的”(或处理后的)样品的LC/MS数据组,SIEVE可自动进行无标记的蛋白和肽段差异分析,从而测定对照组之间的差异,所有的这些步骤都不需要同位素标记。之前,研究者只能比较成对的数据。然而,在生物标志物发现的研究领域内,观察数据趋势是必须的;现在,SIEVE 1.2 可以实现在单个趋势分析中观察多时间点和剂量点。

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        “SIEVE第一次发布后,客户反馈的主要需求是,如何监控蛋白随时间的变化,如何更方便地在肽段和蛋白水平上解释其统计结果。”Thermo Fisher Scientific 蛋白质学市场规划部经理Amy Zumwalt说,“为了满足这一需求,我们在这个版本中加入了趋势分析功能,并且完全重新构建了用户界面。新的向导式界面将使创建差异实验和解释统计结果变得更容易。”

        会上首次发布的软件还有Thermo Scientific 的ProSightPC 2.0,它最初是为“自上而下”(top-down)的蛋白质鉴定和表征而设计的,现在可以支持所有高质量精度、高分辨率的串联质谱蛋白质组学实验。ProSightPC 2.0可以对所有高质量精度的二级质谱(MS2)数据进行高通量处理,无论其来自“自上而下”(top-down),“自中而下”(middle-down),还是“自下而上”(bottom-up)的实验,而且可用已知的翻译后修饰(PTM)表征蛋白质。“Thermo Scientific 的ProSightPC 2.0是专门面向杂交质谱技术的,同时支持新型LTQ Orbitrap XL ETD质谱的数据。”Andreas Huhmer说,“这给研究人员提供了独一无二的工具,可以对蛋白异构体和变异体的错综复杂的差异进行分析。”

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        和SIEVE一样,ProSightPC 2.0采用一种新型图形界面,更易使用,而且重要的是它现在可以对LC/MS的数据文件自动处理。而以前,在处理数据之前必须手动挑选峰。而现在可选择整张色谱图,可对所有的峰进行自动分析了。

如需对Proteome Dynamics了解更多信息,请于2008年8月16日至20日访问阿姆斯特丹的HUPO #34展台,或致电800-810-5118或400-650-5118,电邮analyze.cn@thermofisher.com 或者访问www.thermo.com/orbitrap
Thermo Scientific是Thermo Fisher Scientific的一部分,是全球科学服务领域的领导者

关于赛默飞世尔科技(Thermo Fisher Scientific)
Thermo Fisher Scientific(赛默飞世尔科技)(纽约证交所代码:TMO)是全球科学服务领域的领导者,致力于帮助客户使世界更健康、更清洁、更安全。公司年销售额超过100亿美元,拥有员工约33,000人,在全球范围内服务超过350,000家客户。主要客户类型包括:医药和生物公司,医院和临床诊断实验室,大学、科研院所和政府机构,以及环境与工业过程控制装备制造商等。公司借助于Thermo Scientific和Fisher Scientific这两个主要的品牌,帮助客户解决在分析化学领域从常规的测试到复杂的研发项目中所遇到的各种挑战。Thermo Scientific能够为客户提供一整套包括高端分析仪器、实验室装备、软件、服务、耗材和试剂在内的实验室综合解决方案。Fisher Scientific为卫生保健,科学研究,以及安全和教育领域的客户提供一系列的实验室装备、化学药品以及其他用品和服务。赛默飞世尔科技将努力为客户提供最为便捷的采购方案,为科研的飞速发展不断地改进工艺技术,提升客户价值,帮助股东提高收益,为员工创造良好的发展空间。欲了解更多信息,请登陆:www.thermofisher.com

相关链接:

TMT试剂盒的介绍

磷酸化肽段富集试剂盒的介绍

Kingfisher® Flex 磁珠纯化系统

 

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