【求助】请教高手给分析下非特异性扩增的原因

引物筛选,每条带引物不同,退火温度为56.1.39个循环


20120215.JPG


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最新回复

  • bs4665 (2015-4-03 09:59:28)


    您好楼主,我想问一下您这图片是用自动成像系统扫描上去的?还是用相机照出的?谢谢。
  • mimili_901 (2015-4-03 09:59:44)


    每种引物都有自己最为特异的反应条件,你做这个的目的是什么....
  • 二丫头466 (2015-4-03 10:00:00)


    自动成像的,还请高手给分析一下非特异扩增的原因,怎么弄才清楚
  • mimili_901 (2015-4-03 10:00:19)

    QUOTE:

    原帖由 二丫头466 于 2015-4-3 10:00 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')

    自动成像的,还请高手给分析一下非特异扩增的原因,怎么弄才清楚
    拍出的照片 都这么小吗 可以调节成大图片啊 在拍照时候
  • babybabe (2015-4-03 10:00:37)


    你目的条带是多少~
  • 二丫头466 (2015-4-03 10:00:55)

    我是新手,也不知道要几条,只是想让条带清晰
  • okhaha (2015-4-03 10:01:13)

    有很多原因,
    1、胶的问题
    2、引物特异性不强,
    3、PCR条件不合适,
    4、跑胶时间太长,
    5、酶的特异性不好,可以试试primer start等
    建议楼主在探索以下条件吧
  • vcve (2015-4-03 10:01:30)


    我看你的片段大小不一,推测可能是引物的Tm值不同,你用同一个温度退火的话可能会出现这样情况。你的模板是不是基因组?你如果想一起扩增,你尝试用Touch Down PCR做下,试试从64℃~58℃
  • vcve (2015-4-03 10:01:55)

    一般非特异扩增的原因比较多,诸如:模板过量、循环次数太多(25~35比较适宜)、酶用量过大、引物特异性不好;很有可能是引物自身设计的问题,特异性不好
  • youyou99 (2015-4-03 10:02:31)

    非特异性条带的根本原因还是引物的3`端于其他的模板位置发生了anneal,用NCBI的primer-blast可以检测引物的特异性。Touch down PCR也是个方法,但是也要看3`端和非特异模板匹配位置的TM值,如果这个TM值很高,TOUCH down也是不能解决问题的。至于高保真酶,是无法消除非特异性反应的。
  • 33号 (2015-4-03 10:02:54)

    主要是退火温度和引物的问题,建议提高下退或温度,降低下模板的量或者降低引物的加量,再不行就得重新设计引物了
  • finger (2015-4-03 10:03:09)


    应该是有非特异性扩增吧,重新设计引物试试
  • 短头发 (2015-4-03 10:03:32)


    不用引物如果退火温度不一样,一般不能在一起P的,这样很容易产生非特异扩增,你应该按照每个引物的Tm值设定其合适的退火温度,分别做PCR,结果应该会好点。
  • flower-201 (2015-4-03 10:03:49)

    引物特异性可能不是很高,条带大小也不一样,先升高退火温度试试。