利用小分子极性光切割测定G-四重折叠结构的构象

2011-5-09 10:03 来源: 中国科学院
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动物所利用小分子极性光切割footprinting测定G-四重折叠结构的构象

  基因组中可以形成G-四重折叠结构的序列分布非常广泛,这些结构对诸如癌基因表达的影响使得其成为药物治疗的可能靶点。研究生理条件下基因组双链DNA中的G-四重折叠结构的结构对寻找和设计靶向药物具有非常重要的指导意义。目前的物理学和化学方法很难用于基因组双链DNA的样品测定。

  中科院动物研究所谭铮研究组在研究G-四重折叠结构与化学小分子特异性识别时,建立了一种利用小分子极性光切割footprinting测定G-四重折叠结构构象的方法,可以在双链的单链核酸中解析出形成G-四重折叠结构的四条G-tract的5'-3'走向,从而了解整个G-quadruplex的结构类型。该方法还可以用于证明双链DNA中G-四重折叠结构的形成。

  文章链接:Zheng KW, Zhang D, Zhang LX, Hao YH, Zhou X, Tan Z. (2011). Dissecting the Strand Folding Orientation and Formation of G-Quadruplexes in Single- and Double-Stranded Nucleic Acids by Ligand-Induced Photocleavage Footprinting. J Am Chem Soc. 133(5): 1475-1483.

  该项研究得到了国家科技部和国家自然科学基金的资助。