中国科学家参与全球最大微生物基因组研究项目

2011-3-23 18:37 来源: 人民网
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  中国科学家22日宣布将参与全球最大微生物基因组研究项目(Earth Microbiome Project,EMP),并承担核心工作。该项目旨在全面、系统地研究全球范围内的微生物群落的功能及进化多样性,以便更好地造福人类。

  与以往的微生物研究有所不同,该项目的研究对象不仅仅集中于海洋和人体环境中微生物群落,还包括土壤、空气、淡水生态系统等整个地球表面的绝大多数的微生物群落。该项目将对来自全球的20万个样本进行环境DNA测序或者宏基因组测序从而建立一个全球性的基因图谱。来自华大基因的中国科学家将会负责EMP亚洲地区所有样本的收集和鉴定,并对整个项目提供DNA提取、扩增、建库、宏基因组测序以及研发生物信息学分析流程所需的计算资源。这些信息学分析流程将为EMP产生的海量数据提供一个分析框架。

  EMP的项目负责人、芝加哥大学和阿贡国家实验室的教授Jack A. Gilbert博士说:“华大基因在测序能力、测序技术发展和信息分析等方面已展现出卓越的能力,EMP是一个前所未有的最大的基因组测序项目,作为全球最大基因组学研究中心的华大基因的参与是至关重要的,另外,华大基因对科学追求卓越的态度使其成为参与EMP的理想选择。”

  华大基因理事长杨焕明院士表示:“我们(华大基因)非常荣幸能够作为主要参与者参加如此重要的研究项目。微生物对地球上所有的生命具有至关重要的作用而我们对微生物的复杂性和多样性认识不足,征服这个未知的领域是非常有必要的。华大基因拥有国际先进水平的测序平台和强大的生物信息学分析能力,我们相信我们可以为促进人类对微生物群落的重要性的了解贡献出价值和力量。”

  在地球上,微生物无所不在,除非最为极端的环境,它们在酸性湖泊、深海、冰冻的地方和热泉口都能够生存。地球上的微生物要比其他已知星球上的多,但是,迄今为止,极度缺少对地球上复杂多样的微生物研究。然而,高通量测序技术的应用为探索微生物世界提供可前所未有的机会。与以前的微生物或微生物群体测序相比,EMP的提出将会带来更加巨大的影响。该项目可以获得大约500,000个重测的基因组,一个全球的代谢模型和一个所有信息可视化的数据分析入口,这将可以更好的描述每个生物群落的蛋白质空间结构及环境代谢模型。参与该项目的主要单位有华大基因(BGI)、美国阿贡国家实验室、芝加哥大学、科罗拉多大学、劳伦斯-伯克利国立实验室和美国基因能源联合研究所。