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Transgenomic获ICE COLD-PCR独家使用权

2015.12.29

  分析测试百科网讯  ICP(ICE COLD-PCR™)有可能成为精准医疗中癌症筛查和诊断的重要工具。

  一个全球性的生物技术公司——Transgenomic公司,其优势在于利用先进的诊断测试盒和床研究服务来发展精准医疗,2015年12月23日宣布获得了一个由美国国立卫生研究院(NIH)资助的为期两年的小企业技术转移(STTR)资金。该150万美元的款项将用来建立一个与Dana-Farber癌症研究所合作的项目,旨在增强转基因ICE COLD-PCR™(ICP)(完全COLD-PCR —improved and complete enrichment COLD-PCR)技术的能力。ICE COLD-PCR是由Dana-Farber开发创造的,其给予Transgenomic全球独家使用权利。

  据了解,ICP与传统PCR相比,对突变基因的富集能力更强,灵敏度超过后者500倍,并且能够同数字PCR、传统测序等技术相结合,因而被认为在精准医疗,特别是对癌症的筛查与诊断方面具有更大的应用潜力。

  这项资金将帮助Dana-Farber开发COLD-PCR/ICE COLD-PCR技术的复用形式,该技术能在帮助筛选和富集癌症患者血液中的突变DNA。再结合测序,可以识别和跟踪基因突变,可能引起的耐药性突变以及肿瘤病情复发的早期指示。

  低变性温度共扩增PCR(Co-amplification at lowerdenaturation temperature-PCR,COLD-PCR)是一种新的利用不同Tc值富集少量突变基因而便于检测的方法,具有灵敏度高、特异性较强、重复性好等优点,2008年Li等报道后便得到广泛关注。COLD-PCR不论突变基因存在于什么位置、不论突变是否已知或是何种类型(点突变、插入、缺失),均能从大量野生型基因背景中选择性扩增出少量的突变基因。PCR通常是各种DNA突变检测技术的必须的起始步骤。与普通PCR相比,COLD-PCR对突变的富集能力大大提高,可以大大提高各种突变技术的灵敏度。

  目前,COLD-PCR可分为完全COLD-PCR和快速COLD-PCR的衍生技术(TT-COLD-PCR,temperature-tolerant COLD-PCR)等。如今,COLD-PCR及其衍生技术与高分辨率溶解曲线分析、TaqMan探针、Sanger测序法、NGS等下游检测平台结合, 已开始应用在肿瘤个体化诊疗、无创性产前诊断、HBV基因型耐药检测等领域。

  ICE COLD-PCR是一个改进的技术,用于检测出所有可能的突变。在测序之前使用,通过选择性的放大只是突变的DNA来提高DNA分析能力,该技术对于疾病诊断、监测和治疗是非常有效的。ICP使得突变DNA在非常高的灵敏度—灵敏度相对于传统方法上升到500-fold的监测变成可能。该技术确保了所有的突变都被识别,包括罕见的突变和之前未被发现的新突变。ICP的超高灵敏度同样允许完成使用无论任何组织或液体活体样本包括血液、血浆和尿液的DNA测试。ICP易于集成到目前实验室工作流程,且可与标准Sanger测序、下一代测序、数字PCR和其他技术使用。

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