【求助】为何看不到磷酸化的akt条带?求助!


最近用western做AKT磷酸化的一些试验,前两次曝光后还能看到磷酸化的akt条带,但是这两次,是什么都看不到了,该出现条带的位置,什么信号都没有了!

我的大概步骤如下:
(1)大鼠冰冷PBS灌注后取脑组织,先放入冰冷PBS中,取皮层组织放在EP管内;
(2)迅速转移如-80度冰箱内,一周内提取蛋白;
(3)提取蛋白:将蛋白放在碎冰上解冻;
(4)同时准备RIPA裂解液和蛋白酶抑制剂、磷酸酶抑制剂;
(5)脑组织放入玻璃匀浆器内匀浆,也是低温操作;
(6)12000转离心,并取上清;
(7)蛋白定量;
(8)与上样缓冲液混合,煮沸10分钟,冷却后-20度冻存;
(9)电泳、转膜;
(10)常温封闭1小时,一抗4度过夜(1:1000稀释);
(11)洗膜后二抗1小时,再次洗膜;
(12)曝光
结果是actin条带非常清楚,而磷酸化的akt一点信号没有!漆黑一片!

可能步骤写的也不够详细,各位老师看看我哪些步骤有失误,哪些需要改进?
或者是根据你们的经验,从蛋白提取到曝光,哪些步骤需要特别注意,最有可能哪里出现问题呢?

谢谢大家!

我也来说两句 查看全部回复

最新回复

  • tianmei001 (2013-5-16 11:11:41)


    有没有对照样品啊?要没有对照的话不好分析出到底是样品本身就不磷酸化Akt,还是Akt的wb做的有问题。
  • toy (2013-5-16 11:12:11)

    首先我前两次已经做出了结果,条带也非常清楚,只是最后这两次找不到原因;

    其次呢,最后这两次actin的条带非常清楚,而且我用的是Odyssey Infrared Imaging,actin和磷酸化的akt是要在一张膜上出来的,而且同时做的另一块

    胶非磷酸化的akt也是非常清楚;

    所以我个人感觉,WB应该没有问题!

    希望再次指正!
  • fox_79 (2013-5-16 11:12:34)

    蛋白时间长了,含量少的可能因为多次冻融降解,可以重新提一次蛋白试试。
  • toy (2013-5-16 11:12:59)


    肯定不是冻融的问题!我就解冻过一次!
    而且,开始做的那两次,冻融过至少5次,条带还是很清楚!

    我一直怀疑是P-AKT的特殊性造成的,
    第一是含量少;
    第二是在基础状态下没有磷酸化,刺激处理没做好!
  • PINK (2013-5-16 11:13:21)


    你用的p-AKT的抗体是哪个公司的?我之前也检测过p—AKT,条带很不清楚。可是AKT倒是很好
  • nikonun (2013-5-16 11:13:46)

    最近也在做p-Akt,虽有p-Akt条带,但不是很清楚,且非特异条带很多,而Akt就不涉及此问题,不知是否是抗体原因,我们用的是CST抗体,不知大家用的是哪家公司?
  • NBA (2013-5-16 11:14:20)

    最近用western做AKT磷酸化的一些试验,前两次曝光后还能看到磷酸化的akt条带,但是这两次,是什么都看不到了,该出现条带的位置,什么信号都没有了!

    我的大概步骤如下:
    (1)大鼠冰冷PBS灌注后取脑组织,先放入冰冷PBS中,取皮层组织放在EP管内;
    (2)迅速转移如-80度冰箱内,一周内提取蛋白;
    (3)提取蛋白:将蛋白放在碎冰上解冻;
    (4)同时准备RIPA裂解液和蛋白酶抑制剂、磷酸酶抑制剂;
    (5)脑组织放入玻璃匀浆器内匀浆,也是低温操作;
    (6)12000转离心,并取上清;
    (7)蛋白定量;
    (8)与上样缓冲液混合,煮沸10分钟,冷却后-20度冻存;
    (9)电泳、转膜;
    (10)常温封闭1小时,一抗4度过夜(1:1000稀释);
    (11)洗膜后二抗1小时,再次洗膜;
    (12)曝光
    结果是actin条带非常清楚,而磷酸化的akt一点信号没有!漆黑一片!

    可能步骤写的也不够详细,各位老师看看我哪些步骤有失误,哪些需要改进?
    或者是根据你们的经验,从蛋白提取到曝光,哪些步骤需要特别注意,最有可能哪里出现问题呢?

    谢谢大家!

    =======================================================================

    既然前两次能出来的话,实验方法倒不需要改进,应该属于某种操作错误.或试剂的PH变了之类的.
    重新double check 是否试剂之类的都没有问题,有嫌疑的就重新配吧,特别是tris-hcl之类的.

    然后再做一次看看.
  • toy (2013-5-16 11:14:48)

    非常感谢两位大侠的回答!
    我的两个抗体akt和p-akt都是买的CST公司的;
    我的akt条带也是非常清楚,上样量30ug就很明显了;
    “虽有p-Akt条带,但不是很清楚,且非特异条带很多”,我上两次出来的p-akt条带肯定没有akt的清楚,但是非特异的也不多,只有在20kd左右有一条很亮的非特异条带!
    我感觉不像是抗体的问题,非特异的条带有就有吧,能区别开就行了,关键是自己想要的要出来啊!
  • toy (2013-5-16 11:15:25)

    “既然前两次能出来的话,实验方法倒不需要改进,应该属于某种操作错误.或试剂的PH变了之类的.
    重新double check 是否试剂之类的都没有问题,有嫌疑的就重新配吧,特别是tris-hcl之类的.”
    我感觉实验方法的问题存在的可能性不大,即使有一些电泳和转膜参数的差别,但是也不会影响太大,更不要说一抗和二抗孵育的时间什么的,多10分钟少10分钟问题也不大!
    您把失误的原因放到了试剂上面,这个可能性就更小了,因为所有的试剂,甚至包括tris-hcl,都是购买的现成的,不是自己配制的,只有胶、电泳缓冲液和转膜液是我自己配制的!
    所以我个人感觉问题还是在于样品本身,所以如果哪位大侠做过动物组织的p-akt,那真是太好了!
  • toy (2013-5-16 11:16:58)


    刚才检索CST公司网站的抗体目录,
    cuturl('http://www.cellsignal.com/catalog/primary/targets_a_to_c.html')
    发现p-akt的兔源的抗体至少有三个,货号分别是9271、4060、4058,都可以用于WB,而我用的是9271,当时也不知道怎么选择的,现在看了看这3个抗体的资料,也找不出有什么区别?

    不知道我的问题是不是出在这里?这3个抗体到底有什么区别呢?哪位大侠有这方面的经验呢?
  • H2O (2013-5-16 11:17:21)


    你前两次和这两次的样品有何差异呢?来源、种属是否一致?处理方法是否一致?

    如果都一致,我认为最大的可能性就是有什么地方失误了,再做一次看看。
  • vivian4123 (2013-5-16 11:17:57)

    “既然前两次能出来的话,实验方法倒不需要改进,应该属于某种操作错误.或试剂的PH变了之类的.
    重新double check 是否试剂之类的都没有问题,有嫌疑的就重新配吧,特别是tris-hcl之类的.”
    我感觉实验方法的问题存在的可能性不大,即使有一些电泳和转膜参数的差别,但是也不会影响太大,更不要说一抗和二抗孵育的时间什么的,多10分钟少10分钟问题也不大!
    您把失误的原因放到了试剂上面,这个可能性就更小了,因为所有的试剂,甚至包括tris-hcl,都是购买的现成的,不是自己配制的,只有胶、电泳缓冲液和转膜液是我自己配制的!
    所以我个人感觉问题还是在于样品本身,所以如果哪位大侠做过动物组织的p-akt,那真是太好了!

    ===========================================================================================================

    不好意思,可能没有表达清楚,我说的某种操作错误,指some mistake,是泛指操作上本身会出现的问题,包括样品的处理(比如磷酸化没有被保护好). 而不是客观存在的磷酸化本身的问题.
    所以我的意思是 并不是没有磷酸化,或者您的protocol有问题(因为没有磷酸化或protocol有问题的话,前面两次也不应该出来条带)而是您的什么地方操作的问题.

    good luck
  • mamamiya (2013-5-16 11:19:59)

    当时在买CST公司的p-Akt抗体时,也是纠结了好久,关于这几个抗体的区别,当时问代理商,她们的回答是“货号4058 Phospho-Akt (Ser473) (193H12) Rabbit mAb --兔源单抗,适合做wb,免疫荧光实验,免疫沉淀;货号4060 Phospho-Akt (Ser473) (D9E) XP™ Rabbit mAb --兔源单抗,XP是CST公司的一个专利,是指兔源单抗,纯化级别比较好的产品,这个抗体适合做wb,免疫组化,免疫荧光和免疫沉淀;而货号9271为多克隆抗体。”

    我认为单克隆抗体应该比多克隆抗体好,我们买的是4060,但做出来效果也不是太好,非特异染色很多,特异性条带也不清楚,初步怀疑是抗体稀释度的问题,不知100ml一抗和二抗的稀释度各是多少?
  • kulee (2013-5-16 11:20:43)

    最近用western做AKT磷酸化的一些试验,前两次曝光后还能看到磷酸化的akt条带,但是这两次,是什么都看不到了,该出现条带的位置,什么信号都没有了!

    我的大概步骤如下:
    (1)大鼠冰冷PBS灌注后取脑组织,先放入冰冷PBS中,取皮层组织放在EP管内;
    (2)迅速转移如-80度冰箱内,一周内提取蛋白;
    (3)提取蛋白:将蛋白放在碎冰上解冻;
    (4)同时准备RIPA裂解液和蛋白酶抑制剂、磷酸酶抑制剂;
    (5)脑组织放入玻璃匀浆器内匀浆,也是低温操作;
    (6)12000转离心,并取上清;
    (7)蛋白定量;
    (8)与上样缓冲液混合,煮沸10分钟,冷却后-20度冻存;
    (9)电泳、转膜;
    (10)常温封闭1小时,一抗4度过夜(1:1000稀释);
    (11)洗膜后二抗1小时,再次洗膜;
    (12)曝光
    结果是actin条带非常清楚,而磷酸化的akt一点信号没有!漆黑一片!

    可能步骤写的也不够详细,各位老师看看我哪些步骤有失误,哪些需要改进?
    或者是根据你们的经验,从蛋白提取到曝光,哪些步骤需要特别注意,最有可能哪里出现问题呢?

    谢谢大家!

    ========================================================================================================

    看完上面的回复了,你可以读读我的《WB实战指南》,我在抗体孵育章节专门以p-AKT为例,提到这个抗体最好从R&D购买(货号我没办法查了),CST的两管垃圾(总蛋白和磷酸化的)还一直扔在角落里了。
    当然啦,也许站在今天的高度,可以尝试用其他的抗体稀释液再尝试下;不过如果你不想浪费时间和其他耗材,买R&D最reasonable
  • xingyi08 (2013-5-16 11:22:11)


    我认为不能一概而论CST的抗体,当然就我自己的经验,CST的大多数抗体还是不错的,也许不是最好的,因为有一些生产兔单抗的公司做磷酸化抗体还是很强的。一下是我的图:小鼠细胞稍弱。


    63847778.jpg

  • xingyi08 (2013-5-16 11:27:07)


    CST
    pS473 Cat.#:4060
    pT308 Cat.#: 2965
    Akt pan Cat.#: 4691

    我并不是给CST打广告,而且我做的也没有datasheet上的漂亮,但确实work。

    这个是人的细胞,pT308效果差不多,而Akt pan则非常漂亮,一时没有找到图。


    [ 本帖最后由 xingyi08 于 2013-5-16 16:09 编辑 ]


    41321728.jpg

  • 66小飞侠 (2013-5-16 16:10:32)


    我给一下我自己paper上面用R&D做的图片吧。那个CST的产品我还有点印象,就是条带位置不对呀,杂带倒是很浓。
    几年前的水平,内参还做得不是很好看,呵呵
    Panel A:p-AKT看起来毛楂楂的,是因为显影液有点久了,所以不是很实。


    25840556.snap.jpg

  • toy (2013-5-16 16:11:07)

    你的建议很好,还让我明白了4060那个xp到底是什么意思。一看就是真正做过p-akt的,经验很多,您说的有几个非特异性条带,你知道我多羡慕你吗?我现在是毫无条带啊!
    我用的是Odyssey Infrared Imaging,一抗的稀释度是1:1000,二抗的稀释度是1:5000.

  • toy (2013-5-16 16:12:12)


    我现在下载dxy上的东西总是提示错误,很郁闷的东西!
    我感觉你做的条带已经很清楚了,你说的模糊,有重影,可能也不是发光液的问题,因为akt有akt1、akt2…,而抗体说明书上已经说了和这几个都有反应的!
    说真的,我从来没有怀疑过CST这个公司,没想到这个抗体R&D还是最好的!实验室的老师也是说我的某个操作有问题,但是我不礼貌的说,这跟没说一样!我还是按照你的经验试试吧!
    To lee800265:
    你给了我好多的建议,还把图发了上来,太感谢了!
    我的akt条带甚至比actin还漂亮,但是提到p-akt我头都疼!
    你的p-akt抗体还是很漂亮的,很明显看出各个处理的差别,而我呢,做的还是动物的组织,蛋白量可以很多的,但是还是未见条带,很惭愧!
  • 小野花 (2013-5-16 16:15:03)

    我们一抗稀释度是根据说明书来的,1:2000,二抗1:4000,好像有些高。
    不知您在做WB时转膜后丽春红染色膜上是否有条带,如果有,应该就是后面流程的问题,如封闭、洗膜、一抗、二抗、显色等。还是找找原因吧。