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【求助】pET32a空载体蛋白表达在哪里?
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发表于: 2014-2-04 00:01 作者: 阳光树 来源: 分析测试百科网
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【求助】pET32a空载体蛋白表达在哪里?
pET32a空载体蛋白表达在上清中还是在沉淀里?怎么我的空载体表达在沉淀里呢?应该是这样吗?
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【求助】pET32a空载体蛋白表达在哪里?
我也来说两句
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biabiade
(2014-2-04 00:02:00)
你说的上清是指什么?是细菌培养上清吗?还是指细菌裂解后所得的上清?
通常重组蛋白表达部位分下列几种
1)分泌性表达,表达的重组蛋白存在于培养上清或细菌的周质空间。(由于大肠杆菌有很厚的细胞壁,在分泌信号肽的引导下,重组蛋白一般分泌到细胞壁和细胞膜之间的周质空间,无法像真核生物那样分泌到培养上清里面。所以在大肠杆菌分泌性表达又叫周质空间表达。)
2)胞质可溶性表达,表达的重组蛋白存在于细胞质中,用适宜的裂解液裂解宿主微生物后,重组蛋白存在于裂解后的上清中。
3)包涵体表达。表达的重组蛋白也存在于细胞质中,只是由于重组蛋白聚集成不溶性的包涵体团块,所以裂解宿主微生物后,重组蛋白存在于裂解后的沉淀中,需要用强变性剂比如尿素,SDS等才能溶解。
4)膜表面表达,这多见于细胞转导通路和表面展示技术的研究。表达的重组蛋白携带有合适的跨膜结构域,从而使其镶嵌在细胞膜上。
5)核内表达,这多见于酵母双杂交或转录因子的研究。表达的重组蛋白携带有核定位信号,能够引导其进入细胞核发挥功能。
PET32a空载体表达的重组蛋白主要是TRX片段,这个蛋白在通常的诱导条件下,有很大比例以可溶性形式存在于细菌的胞质里。也有部分以包涵体形式存在。
阳光树
(2014-2-04 00:02:22)
你好,我说的上清是指细菌裂解后的上清。但是我用1mmol IPTG诱导4个小时,上清中什么也没有,沉淀里有东西,但是没看出是明显的表达带来。请问我该怎么修改条件?
seagate
(2014-2-04 00:02:54)
是说什么蛋白都没有吗?怎么确认的?
abc816
(2014-2-04 00:03:39)
你好,我说的上清是指细菌裂解后的上清。但是我用1mmol IPTG诱导4个小时,上清中什么也没有,沉淀里有东西,但是没看出是明显的表达带来。请问我该怎么修改条件?
===============================================================================================================
1mM IPTG诱导4小时可以了。如果想要可溶性比例高一点,可以试试25度诱导过夜。也可以将IPTG浓度减为0.2mM试试。
但你说一点都没有表达,那我就感觉有点问题了。如楼上所说,不知道你是通过什么方法检测的?是SDS-PAGE电泳吗?PET32空质粒的表达产物只有大约10KD,一般的SDS-PAGE可能比较难跑出来,跑小分子量蛋白胶比较好,不知这点你有没有注意。另外不知你用什么方法裂解的,裂解效果如何。裂解后的上清,即使没有目的蛋白也应该有不少杂蛋白的。你说上清中什么也没有,是指没有任何蛋白条带吗?如果是这样,那说明你的裂解方法有问题。
阳光树
(2014-2-04 00:04:06)
对不起,我没有说清楚。我是用超声裂解的,然后用SDS-PAGE电泳检测,上清和沉淀中都有蛋白条带,但是上清中明显少,而且空载体和目的基因表达情况完全相同,没有明显的表达迹象,怎么回事?
另外,pET32a载体上应该有三个标签蛋白,S tag、His tag和Trx tag,所以空载体表达产物应该是26KD左右吧?为什么是10KD呢?请指教!
abc816
(2014-2-04 00:04:48)
对不起,我没有说清楚。我是用超声裂解的,然后用SDS-PAGE电泳检测,上清和沉淀中都有蛋白条带,但是上清中明显少,而且空载体和目的基因表达情况完全相同,没有明显的表达迹象,怎么回事?
另外,pET32a载体上应该有三个标签蛋白,S tag、His tag和Trx tag,所以空载体表达产物应该是26KD左右吧?为什么是10KD呢?请指教!
==============================================================================================================
不好意思,这点是我记错了,空载体的表达产物确实是26KD,我忘了还有两个TAG。从你的描述来看,实验过程应该没有问题。那么具体问题在哪只能逐项排查了。你说空载体和目的基因表达情况相同,那么空载体的诱导和非诱导组有没有差别?空载体和未转化的宿主菌有没有差别?通过观察这些可以检测你的诱导情况。另外有条件的话最好做个Western,有时表达弱的话,在众多的杂带中,可能无法分辨出来。
bamboo16
(2014-2-04 00:05:05)
有意思,上清中可能没有,可能有。通过SDS-PGAE 看不见,不能证明其没有,可能是量少检测不到而已。许多文献证明Trx可溶性表达的几率是很大的。
阳光树
(2014-2-04 00:05:25)
空载体的诱导和非诱导组有差别,今天我用别人的pGEX-6p-1载体做对照,结果他的很容易就有表达,非常明显的表达,而我的依然没有,郁闷!我今天用25度诱导了7个小时。
131415
(2014-2-04 00:05:42)
你的蛋白是不是可溶的?有没有可能在沉淀之中?能不能把沉淀跑一个电泳?
阳光树
(2014-2-04 00:06:03)
沉淀也跑了,没有!
131415
(2014-2-04 00:06:19)
把你的空pGEX-6p-1测个序,估计是载体出问题了。不过既然跟别人要到新载体,就不需要纠缠这些问题了。
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biabiade (2014-2-04 00:02:00)
你说的上清是指什么?是细菌培养上清吗?还是指细菌裂解后所得的上清?
通常重组蛋白表达部位分下列几种
1)分泌性表达,表达的重组蛋白存在于培养上清或细菌的周质空间。(由于大肠杆菌有很厚的细胞壁,在分泌信号肽的引导下,重组蛋白一般分泌到细胞壁和细胞膜之间的周质空间,无法像真核生物那样分泌到培养上清里面。所以在大肠杆菌分泌性表达又叫周质空间表达。)
2)胞质可溶性表达,表达的重组蛋白存在于细胞质中,用适宜的裂解液裂解宿主微生物后,重组蛋白存在于裂解后的上清中。
3)包涵体表达。表达的重组蛋白也存在于细胞质中,只是由于重组蛋白聚集成不溶性的包涵体团块,所以裂解宿主微生物后,重组蛋白存在于裂解后的沉淀中,需要用强变性剂比如尿素,SDS等才能溶解。
4)膜表面表达,这多见于细胞转导通路和表面展示技术的研究。表达的重组蛋白携带有合适的跨膜结构域,从而使其镶嵌在细胞膜上。
5)核内表达,这多见于酵母双杂交或转录因子的研究。表达的重组蛋白携带有核定位信号,能够引导其进入细胞核发挥功能。
PET32a空载体表达的重组蛋白主要是TRX片段,这个蛋白在通常的诱导条件下,有很大比例以可溶性形式存在于细菌的胞质里。也有部分以包涵体形式存在。
阳光树 (2014-2-04 00:02:22)
seagate (2014-2-04 00:02:54)
abc816 (2014-2-04 00:03:39)
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1mM IPTG诱导4小时可以了。如果想要可溶性比例高一点,可以试试25度诱导过夜。也可以将IPTG浓度减为0.2mM试试。
但你说一点都没有表达,那我就感觉有点问题了。如楼上所说,不知道你是通过什么方法检测的?是SDS-PAGE电泳吗?PET32空质粒的表达产物只有大约10KD,一般的SDS-PAGE可能比较难跑出来,跑小分子量蛋白胶比较好,不知这点你有没有注意。另外不知你用什么方法裂解的,裂解效果如何。裂解后的上清,即使没有目的蛋白也应该有不少杂蛋白的。你说上清中什么也没有,是指没有任何蛋白条带吗?如果是这样,那说明你的裂解方法有问题。
阳光树 (2014-2-04 00:04:06)
另外,pET32a载体上应该有三个标签蛋白,S tag、His tag和Trx tag,所以空载体表达产物应该是26KD左右吧?为什么是10KD呢?请指教!
abc816 (2014-2-04 00:04:48)
另外,pET32a载体上应该有三个标签蛋白,S tag、His tag和Trx tag,所以空载体表达产物应该是26KD左右吧?为什么是10KD呢?请指教!
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不好意思,这点是我记错了,空载体的表达产物确实是26KD,我忘了还有两个TAG。从你的描述来看,实验过程应该没有问题。那么具体问题在哪只能逐项排查了。你说空载体和目的基因表达情况相同,那么空载体的诱导和非诱导组有没有差别?空载体和未转化的宿主菌有没有差别?通过观察这些可以检测你的诱导情况。另外有条件的话最好做个Western,有时表达弱的话,在众多的杂带中,可能无法分辨出来。
bamboo16 (2014-2-04 00:05:05)
有意思,上清中可能没有,可能有。通过SDS-PGAE 看不见,不能证明其没有,可能是量少检测不到而已。许多文献证明Trx可溶性表达的几率是很大的。
阳光树 (2014-2-04 00:05:25)
空载体的诱导和非诱导组有差别,今天我用别人的pGEX-6p-1载体做对照,结果他的很容易就有表达,非常明显的表达,而我的依然没有,郁闷!我今天用25度诱导了7个小时。
131415 (2014-2-04 00:05:42)
阳光树 (2014-2-04 00:06:03)
131415 (2014-2-04 00:06:19)
【求助】pET32a空载体蛋白表达在哪里?