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基因组测序方法和技术研发取得多项新进展

2012.11.29

  包括东京大学在内的多家日本机构合作开发出一种可与新一代测序技术(NGS)联合使用检测蛋白互作组的技术,即无细胞展示技术。NGS通过与无细胞展示技术联合检测蛋白间互作,具有高通量、广覆盖率且无须利用克隆等特点,尤其能提高数据的可靠度。

  美国哥伦比亚大学的一个研究小组开发出一种能显著提高碱基识别效果的新型纳米孔测序技术。该方法用特定的标签对4种碱基进行修饰,在聚合酶链式反应过程中,修饰过的碱基被用于DNA链的延伸,而其标签则会被释放出来并依次进入纳米孔。通过检测4种大小不同的标签产生的离子电流阻断信号差异,能够在单分子水平上准确地区分4种DNA碱基。该方法解决了目前纳米孔测序中由于4种碱基化学结构相似导致穿过纳米孔时电流变化差异小而不能准确分辨的问题。

  加拿大研究人员开发出一种检测姊妹染色体交换的单细胞测序新方法Strand-seq。该方法能分别对单细胞的双亲DNA模板链进行测序,获得高分辨率的姊妹染色体交换图谱。

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