【讨论帖】细胞蛋白电泳奇怪图形

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我刚做WB,现在先只做到电泳,然后考马斯亮蓝染色。请问大家跑全蛋白的话假如做的好的话应该是什么样子呢?我用的是10%的胶,蛋白浓度1.1mg/ml,每孔上了15微升的样,跑出来的蛋白几乎全集中在60——110KD之间,也分不出条带,只是一团,其他位置就没有多少蛋白了,这是怎么回事呢?
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  • guagua (2014-4-14 16:56:51)

    下图为原图,10%分离胶,左边两道是marker:分别为116,66.2,45,35,25,18.4,14.4
    后面六道是提取的全蛋白,2乘的上样缓,每孔共上15ul,蛋白浓度1.1mg/ml。
    最后两道是蛋白样品不够了,放在四度冰箱里很久的BSA,居然跑出了条带!


    65396792.snap.jpg

  • glass (2014-4-14 16:57:25)


    蛋白样品是如何处理的?估计和你的样品有关!
  • guagua (2014-4-14 16:57:49)

    蛋白样品是如何处理的?估计和你的样品有关!
    样品是购买的碧云天的成品裂解液,主要成分为20mM Tris(pH 7.5),150mM NaCl,1% Triton X-100,以及sodium pyrophosphate, β-glycerophosphate,EDTA,Na3VO4,leupeptin 。50ml的培养瓶加了300微升裂解液,冰上裂解30分钟。然后-80度保存。电泳前加入上样缓冲液后100度煮5分钟。
  • glass (2014-4-14 16:58:09)

    上样前离心了么?
  • guagua (2014-4-14 16:58:31)

    上样前没有离,但是提蛋白的时候离过了12000g 10分钟
  • guagua (2014-4-14 16:58:50)

    我是一个人做WB的,没怎么看过别人做,都是从书上和园子里看来的方法。跑的好的全蛋白应该是什么样子的呢?
  • glass (2014-4-14 16:59:11)


    1.是样品裂解后,离心12000g 10分钟取上清 ,然后冻存的么?如果是的话,应该可以,离心已经去掉细胞碎片等了。
    2.你的样品上样时是否太粘了,如果太粘就不容易跑下去。适当稀释一下,再电泳看看。
    3.按你的蛋白浓度,上样量不用这么大也可以,如果是1.0mm,10孔的小胶梳子 ,上10微升也不少了。
  • guagua (2014-4-14 16:59:29)

    是离心之后取上清又-20度冻存的,做的是5ml的小胶,十孔的梳子。
  • vcve (2014-4-14 16:59:50)


    上样缓冲液中是否有SDS,样品是否清亮?
  • lxh031 (2014-4-14 17:00:26)


    哈,这里很热闹啊,我也来凑个热闹
    楼主比较一下你的图与下面的图有无相似之处,若有,那我再继续;若无,那我就无话可说了


    36957394.snap.jpg

  • guagua (2014-4-14 17:00:49)

    楼主比较一下你的图与下面的图有无相似之处,若有,那我再继续;若无,那我就无话可说了
    是的,中间没有跑开的部分跟我的一模一样啊
  • guagua (2014-4-14 17:01:09)

    上样缓冲液中是否有SDS,样品是否清亮?
    缓冲液中有SDS,是清亮的
  • fei1226com (2014-4-14 17:05:20)

    为什么不在这里公开说说??让大家都了解一下有好处嘛
  • yapuyapu (2014-4-14 17:06:15)

    QUOTE:

    原帖由 fei1226com 于 2014-4-14 17:05 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')
    为什么不在这里公开说说??让大家都了解一下有好处嘛
    原因有2
    1 本次想借用楼主的典型例子,开展有奖读图分析活动,为本版首次尝试,欢迎大家畅谈己。
    2 原因可能是多种多样的,我的观点也是猜测,在楼主进一步验证结果出来之前,还不能完全肯定。楼主已经同意验证,欢迎各位积极发表个人对本问题的看法。
  • fsdd817 (2014-4-14 17:09:04)


    电泳缓冲液的pH是多少?
  • xyw5 (2014-4-14 17:09:25)

    电泳缓冲液的pH是多少?
    电泳缓冲液是很久以前配的,当时配的时候是调到8.3,10乘的储液,临用时稀释十倍,没有再测PH,估计应该没有大问题吧,因为marker跑的还行。
  • gogo (2014-4-14 17:13:14)


    楼上最好还是把图片贴出来吧,这样更利于大家分析原因。
    电泳缓冲液贮存液不需要调pH 的,配完了用时稀释到1乘,就是8.3。
    你这个贮存液调到8.3,我觉得不对,稀释后pH会变了吧 。
    电泳时,pH很重要,无论是配胶的tris还是电泳缓冲液。
  • duoduo (2014-4-14 17:14:25)


    我也是用的像楼主配的电泳缓冲液,先配好调好PH值,用的时候再稀释直接用,没有再进行调整PH值,我们的胶都跑开了啊,没有出现楼主的问题,所以我觉得原因应该不是这个吧
    再说了,他的marker不是还跑的还行么,呵呵
    我个人认为还是对你的样品用样品处理液处理的时候没有做好吧
    我也是菜鸟,期待高手予以解决!
  • redbutterfly (2014-4-14 17:14:45)


    上样缓冲液是配的还是买的,什么条件保存,有没有完全解冻混匀,吸取的量是否足够?最终上样是1*吗?
    marker能跑好,说明胶没问题,如果不考虑蛋白制备问题的话,这个很值得考虑
  • guagua (2014-4-14 17:15:04)

    上样缓冲液是配的还是买的,什么条件保存,有没有完全解冻混匀,吸取的量是否足够?最终上样是1*吗?
    marker能跑好,说明胶没问题,如果不考虑蛋白制备问题的话,这个很值得考虑
    上样缓冲液是在上海生工购买的,说明上让常温保存,我放在四度的,是2乘的,即和样品是一比一的关系。
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