2013年11月19日,深圳国家基因库宣布一项具有重要开创性意义的国际“千种鱼转录组计划”(1, 000 Fish
Transcriptome,Fish
T1K)正式启动。该项目旨在解密鱼类的起源、进化、生殖、发育、性别调控和免疫等问题,助力科研人员开发出新的技术及策略,以更好地应对鱼类育种、疾病防控、海洋食品安全和生物多样性保护等带来的诸多挑战。

  相对于其他鱼类转录组研究,千种鱼转录组计划规模之大、学科交叉之广、综合性之强,在全球范围内尚属首例。该项目产出的所有数据将通过国家基因库进行公开,以保证科学家可以实时掌握鱼类研究动态及RNA-seq测序技术的最新应用。

  鱼类是所有脊椎动物中种类最多的群体。据估计,全球鱼类约有3万余种。很多鱼类具有极大的经济价值和医学价值,同时在生态保护中起着重要的作用,是自然界生物多样性的一个重要组成部分。测序技术和生物信息分析工具的飞速发展,使大规模鱼类转录组研究成为可能。但是,到目前为止,仅有约10种鱼类的基因组被公开报道。此外,NCBI公共数据库中,仅有80多种鱼类转录组数据。“鱼类组学数据的缺乏激发我们去建立一个大规模的鱼类转录组数据库。”深圳国家基因库负责人张勇指出。