蛋白质技术实现突破 IBM助力癌症研究

2010-6-25 11:52 来源: 太平洋电脑网
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  近日,IBM宣布全球网格大同盟助力”征服癌症”项目取得重大突破,科学家可以通过计算系统对以前复杂的手动流程实现自动化,加速识别与癌症有关的蛋白质结构,找出治愈癌症的最佳方案。

  “结晶化”技术被攻克,蛋白质识别速度大幅提升

  据世界卫生组织透露,2007年,在全球总的死亡人口中,癌症占13%。 该组织声称,2008年新增癌症病例1270万例,死亡760万人。在今后20年内,每年诊断出来的新增癌症病例将骤增至2100万,将有1300万人死于癌症。

  IBM全球网络大同盟“征服癌症”项目旨在建立一个计算系统,用来准确识别固化蛋白质样本,实现样本x光检查,方便科学家进一步探索某些可能引发癌症的蛋白质的结构、形状和相互之间的作用。这个蛋白质样本固化流程叫做“结晶化”, 现已攻克。通过改进蛋白质 X 射线结晶学,研究人员能够更快地确定多种与癌症相关的蛋白质的结构,发现可能的药物介入方法,以便攻克这种致命的疾病。

  在过去,人们不可能对某个给定的蛋白质的9,216张图片全部进行人工检查。即便有人试图以每秒一张图片的速度对图像进行检查,检查完所有12,500个蛋白质的图像也需要1,333天。人为评估也会有很大变化,即使同一个人也会存在不一致的情况。计算机检查同时具有定性和定量两方面的优势。但是,在对晶体识别流程实现自动化的早期阶段,计算机的准确率当时只有70%,而且只能对大约850个特征进行检查,现在已经能够对大约15,000个特征进行分析。

  现在,通过全球网络大同盟,全球150万电脑用户志愿贡献剩余计算能力,参与数据处理。借助强大的计算处理能力,新的系统下,科学家们可以成功识别80%带有晶体的图像以及结晶之前存在98%的清澈蛋白质溶液液滴。 与人为检查相比,它对每个蛋白质进行检查的图像数量可以达到前者的6倍,而时间却极大地缩短。

  IBM热心公益,全球网络大同盟服务社会

  全球网格大同盟是IBM全球公众事业合作部公益捐赠合作项目的一项内容。当今世界,约有10亿台个人计算机,其中大多数的使用时间不到5%。想方设法使目前没能被充分运用的计算力最终造福全人类,这就是全球网格大同盟的宗旨。IBM全球董事长及首席执行总裁彭明盛于2004年11月16日向公众宣布全球网格大同盟将成为造福人类社会最大的公众网格。

  全球网格大同盟目前已经成为化学领域有关蛋白质方面的权威数据库。这些数据可以帮助全球科研人员揭开众多癌症生长的神秘面纱,例如,乳腺癌、前列腺癌或者儿童白血病。同时,利用IBM的慈善处理器,通过对晶体的识别实现自动化,可加速各种生物科学和基因研究项目的研究速度,可以用于对其它试图获取蛋白质结构的项目。例如,全球营养水稻项目――利用全球网格大同盟来探索如何培育出抗病能力更强的水稻;发现治疗登革热的药物项目――发现有希望对抗登革热、丙型肝炎、西尼罗河病以及黄热病等病毒的药物的线索等。

  据统计,全世界20%的新发癌症病人,以及24%的癌症死亡病人都在中国,目前中国的癌症生存患者和治愈患者仅为13%。促进蛋白质结晶技术的快速发展,可以为预防、早期诊断及治疗癌症,提供更多的技术可行性,对中国意义重大。

  为此,IBM中国公众事业合作部经理彭文杰女士表示:“‘征服癌症’项目所取得的成果,说明了全球网格大同盟为科学领域带来的巨大价值。那些自愿捐献PC处理器计算资源的人,为中国和世界攻克癌症的发展进程做出了巨大贡献。他们值得为此而骄傲。”