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2015CNHUPO生物质谱高级研讨会成功举办

2015.1.28

　　2015年1月22日，“2015CNHUPO生物质谱高级研讨会”在北京文津国际酒店隆重召开。此次活动以“蛋白定量”为主题，旨在积极促进我国生物质谱技术的发展和应用，加强国内外相关研究领域的专家学者之间的交流与合作。特邀Dr. Mike MacCoss (University of Washington)，Dr. Robert Everley (Harvard Medical School-Steve Gygi Laboratory) 和刘斯奇教授、邓海腾教授、纪建国教授等多名国内知名专家围绕生物质谱在蛋白定量上的应用做专题报告，吸引了行业内专家学者近300余人参加。本次会议由中国人类蛋白质组组织(CNHUPO)主办，赛默飞世尔科技（中国）有限公司独家赞助，分析测试百科网全程参与并记录了此次会议。

　　北京蛋白质组研究中心钱小红女士

　　会议伊始，北京蛋白质组研究中心技术总监钱小红女士致辞。钱女士首先表示非常欢迎前来参加2015CNHUPO生物质谱高级研讨会的各位业内专家学者，特别邀请并感谢Mike MacCoss，Robert Everley等外国教授前来做报告，非常感谢赛默飞世尔科技对此次报告会议的倾情赞助。最后祝愿参会观众能够享受这次生物质谱前沿技术邀请报告会。

　　华盛顿大学 Mike教授

　　来自华盛顿大学的Mike教授带来题目为《Plenary session I--DIA/PRM Enabling proteomics to shift from list building to robust quantitative measurements》的报告。在2006年以前,利用软件构建针对蛋白质组学的方法还不存在，也没有能够跨越供应商的数据分析软件。Mike教授认为，应该有一种可以替代srm或有很好针对性的二级质谱软件，能够有目的和选择性地接收宽带数据，当有一个新的目标肽时，避免重新运行实验。他在报告中介绍了采用skyline软件进行SRM和DIA定量的分析流程，同时介绍了multiplex和overlap两种新的DIA改进模式，可有效改善DIA定量实验的选择性。

　　中国科学院大连化学物理研究所周愿博士

　　来自中国科学院大连化学物理研究所的周愿博士带来题目为《基于质量亏损的蛋白质组定量新方法》的报告。周愿博士主要分享了三种该实验室开发的定量方法。一，基于质量亏损的二级碎片离子定量方法。该方法碎片离子相差5mDa，需要使用基于Orbitrap的超高分辨率质谱平台才能分开。该方法在LTQ Orbitrap Velos质谱平台上测试，定量准确性较好，98%的蛋白有定量信息，有4个数量级的动态范围。二，基于质量亏损的a1离子定量方法。基于质量亏损的二级碎片离子定量方法需要较高的分辨率，需要使用基于Orbitrap的超高分辨率质谱平台。该实验在 Q Exactive质谱平台上完成，二级分辨率设置为35K时，98%的肽段含有a1离子。基于a1离子的定量方法定量准确度较高，1:50的比值下依然能得到较准确的比值。三，基于质量亏损的SILAC定量方法。pSILAC定量方法是使用两种质量相差36mDa的赖氨酸进行标记，y离子进行定量。pSILAC定量方法准确度和精确度较好，97%的蛋白有定量信息。

　　清华大学生命科学学院邓海腾教授

　　来自清华大学生命科学学院的邓海腾教授带来题目为《结合蛋白质组学和代谢组学研究细胞稳态》的报告。该课题由汤海平博士完成，尚未发表。癌细胞中Hsp60高表达使抗氧化能力提升，该研究使用Q Exactive结合TMT定量方法研究Hsp60 knockdown和过表达两组样本，并同时进行蛋白质组和代谢组分析，发现与两个新陈代谢和能量代谢pathway相关。其中代谢组学部分与清华大学刘晓蕙教授组合作完成，采用Q Exactive，TSQ quantiva（MRM）进行相关代谢通路的研究。

　　华盛顿大学 Mike教授

　　来自华盛顿大学的Mike教授带来题目为《The Chorus Project: A community solution for the storage, sharing, and analysis of mass spectrometry data》的报告。数据管理和分析面临着许多重要问题，例如高价值的数据量越来越多，经济学和文化对数据的需求越来越大，数据储存和运输要求越来越高，算法改进的影响等等。Mike教授在报告中介绍了一个新的网络平台，所有实验室均可在其平台上进行数据的储存、分析、共享等，并在未来希望可以进行在线的快速数据检索。

　　哈佛学院 Robert教授

　　来自哈佛学院的Robert教授带来题目为《Plenary session II--TMT/SILAC quan The Power of Multiplexing for Comprehensive Quantitative Proteomics》的报告。Multiplexing标记（如TMT）大量节省机时，且基于Orbitrap Fusion的SPS MS3定量准确性、灵敏度均有显著提高，采用该方法对结肠癌细胞系进行蛋白组定量，超过7200个蛋白可获得定量信息。此外，报告还对KRAS激活状态下EGF信号通路进行定量磷酸化蛋白质组学研究工作进行了介绍，用10-plex TMT MS3方法分析未分级的脑及肝脏组织样品，实验发现Fusion MS3的高质量谱图数是前一代质谱的1.8倍。Steve Gygi组对Orbitrap Fusion的优异性能给出了极高评价。

　　北京大学生命科学学院纪建国教授

　　来自北京大学生命科学学院纪建国教授带来题目为《通过TMPP进行高准确度多肽从头测序、定量，以及磷酸化位点确定》的报告。生物学和生物医学的问题正在逐渐被社会所关注，例如蛋白质定量、修饰与功能的关系，重大疾病的发病机制、靶标、标志物、治疗监控等。纪建国教授在报告中介绍了一种新的定量技术，即应用TMPP标记方法，一方面可以简化二级质谱图，另一方面可以把CID和ETD谱图整合起来获得质量更高的质谱图，从而获得更好的定量结果，此外，纪教授还介绍了应用于这种技术进行多肽从头测序和磷酸化分析的结果。

　　复旦大学生物医学科学研究所申华莉研究员

　　来自复旦大学生物医学科学研究所的申华莉研究员带来题目为《定量脂组学和蛋白组学联合研究肝癌转移过程中的脂质代谢调控》的报告。申华莉老师首先介绍了脂类组学相关内容，随后对团队的研究工作进行了讲述，申老师介绍了通过对3种转移程度不同的肝癌细胞系的脂质组学进行分析，确定了转移的差别可能与2种脂肪酸的比例失调有关，并进一步通过蛋白质组学分析，确定其可能的机制，并发现了STAT3可能与其相关。

　　中国科学院北京基因组研究所刘斯奇教授

　　来自中国科学院北京基因组研究所的刘斯奇教授带来题目为《利用定量蛋白质组学研究mTOR相关的信号通路》的报告。mTOR具有多种功能，mTOR信号与生物功能相关的分子机制和疾病也有待探索。刘教授认为由mTOR信号识别表达是理解mTOR功能机制的一个关键。报告中介绍了通过mTOR相关mRNA和差异蛋白质组学分析，认为 mRNA测量不能真正反映蛋白质功能分子的变化，并对mTOR相关蛋白进行全面的功能分析。

　　赛默飞世尔科技组学市场总监 Andreas先生

　　来自赛默飞世尔科技组学市场总监Andreas先生带来题目为《Protein Quantitation -which LCMS method is right for my experiment？》的报告。蛋白质定量转换有敏感、准确、广泛的动态范围，而且最小的方法开发不需要选择转换。Andreas先生在报告中介绍了通过TMT标记研究阐明生物在空间和时间的多路复用，并且证明蛋白质复合物及其交互需要可再生的蛋白质网络覆盖率和DIA分析策略，这对理解细胞信号事件多路复用和等量化方法如何满足精度需要提供了帮助。

　　赛默飞世尔科技王璐博士

　　来自赛默飞世尔科技的王璐博士带来题目为《推动多重定量组学技术流程的进一步完善》的报告。在多重蛋白组分析细胞分化研究中，细胞分化过程中的蛋白组会非连续性变化，而现有的多重标记的定量实验流程中，多肽定量缺乏合适的方法。王博士介绍了thermo新开发的两种新型肽段定量的方法，比色法肽段定量（CPQ）和荧光法肽段定量（FPQ），其实验结果精确，比普通的BCA法更加灵敏。随后王博士又介绍了一种新的反相高pH值反相萃取柱，简便易用，其效果和反相高效液相色谱的结果类似。

　　赛默飞世尔科技轩玥博士

　　来自赛默飞世尔科技的轩玥博士带来题目为《Novel DIA techniques--DIA/WiSIM/etc Using novel data independent analysis methods to obtain characterization of a biological pathway 》的报告。轩玥女士首先介绍了数据独立分析和传统的定量工具，随后引出DIA技术的重要性，它能实现极限的性能，有着超高的质量精度以及高分辨率的全扫描功能，是一项很有意义的技术，并系统介绍了应用thermo仪器进行DIA分析的3种方法。

　　报告会结束后，赛默飞又举行了有奖问答活动，参会者踊跃参加，场面热闹非凡。