【求助】帮忙分析下PCR结果吧!

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大家好!这是我用菌落pcr产物跑的琼脂糖凝胶电泳图,恳请大家帮忙分析下出现这种情况的原因吧,谢谢!!
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最新回复

  • october7 (2015-1-14 16:51:23)


    都没有明显的条带出来,二号孔有一点。。不过算了吧。
    首先,要做对照。检验体系是否有问题。
    其次,有可能是菌落挑得太多,影响体系,回导致做不出来的。
    最后,不知道你的引物有没有问题,一般没问题的
  • 小螺号 (2015-1-14 16:51:39)

    QUOTE:

    原帖由 october7 于 2015-1-14 16:51 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')

    都没有明显的条带出来,二号孔有一点。。不过算了吧。
    首先,要做对照。检验体系是否有问题。
    其次,有可能是菌落挑得太多,影响体系,回导致做不出来的。
    最后,不知道你的引物有没有问题,一般没问题的 ...
    对照是什么意思,是不是不加模版的对照,还是阳性对照?请不吝指教!
  • luoliqiong (2015-1-14 16:51:54)


    你也把体系和程序附上来啊,这样咋分析O(∩_∩)O~菌液PCR不好做,可以提质粒再做啊
  • 小螺号 (2015-1-14 16:52:22)

    QUOTE:

    原帖由 luoliqiong 于 2015-1-14 16:51 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')

    你也把体系和程序附上来啊,这样咋分析O(∩_∩)O~菌液PCR不好做,可以提质粒再做啊
    PCR 反应程序: 94 ℃× 5min
                        94 ℃× 1min -- 56 ℃×3 min--72℃× 3 min, n = 35 次
                        72℃× 10 min

    PCR反应体系为25μl:  
          PremMix   12.5μl
          上游引物        1μl
          下游引物        1μl
          模板              2μl
          水           补至25μl(8.5μl)
    请指教,谢谢!



    补充内容 (2012-7-17 15:50):
    目的条带为1468bp
  • viviwang1987 (2015-1-14 16:52:42)


    从电泳条带来看,不知道你目的产物片段大约是多少,如果较大的话,那么最前面不到100bp的应该是引物二聚体,另外,可以把退火时间稍微缩短一下,模板加1ul试试看
  • viviwang1987 (2015-1-14 16:52:58)

    对照是什么意思,是不是不加模版的对照,还是阳性对照?请不吝指教!

    --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

    可以做出来的对照~前提是你配置PCR反应体系的时候,是一起配置的,最后分成几份,才加进去DNA。。。这样的话,在同一条件下,若对照可以做出来,其他做不出来就可以判断不是体系有问题了,可以判断为:菌加太多,或菌落根本没有这基因。
    若对照也没做出来:可以判断体系出问题了~~即配置的溶液,你操作出问题等等或引物降解,或PCR参数出问题了~~所以做对照很好哟
  • tuomu45 (2015-1-14 16:53:24)

    PCR 反应程序: 94 ℃× 5min
                        94 ℃× 1min -- 56 ℃×3 min--72℃× 3 min, n = 35 ...

    ===============================

    这个体系按照说明书,应该没问题的。。。
  • 小螺号 (2015-1-14 16:53:50)

    PCR 反应程序: 94 ℃× 5min
                        94 ℃× 1min -- 56 ℃×3 min--72℃× 3 min, n = 35 ...

    ===============

    目的条带为1468bp
  • 小螺号 (2015-1-14 16:54:09)

    从电泳条带来看,不知道你目的产物片段大约是多少,如果较大的话,那么最前面不到100bp的应该是引物二聚体, ...

    =================

    目的条带为1468bp
  • shenkunjie (2015-1-14 16:56:14)

    QUOTE:

    原帖由 小螺号 于 2015-1-14 16:54 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')
    从电泳条带来看,不知道你目的产物片段大约是多少,如果较大的话,那么最前面不到100bp的应该是引物二聚体, ...

    =================

    目的条带为1468bp

    其实你的菌液鉴定结果应该基本都是阳性,Marker2000  1000--2000之间的若隐若现的带应该就是,但是目的带太弱了,二聚体太强,可以把引物的量减半,模板增加一些。试试、
  • 小螺号 (2015-1-14 16:56:40)

    QUOTE:

    原帖由 shenkunjie 于 2015-1-14 16:56 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')


    其实你的菌液鉴定结果应该基本都是阳性,Marker2000  1000--2000之间的若隐若现的带应该就是,但是目的带太弱了,二聚体太强,可以把引物的量减半,模板增加一些。试试、 ...
    您好,我可不可以直接用PCR产物做模版,在跑一次PCR,谢谢!
  • yjf1026 (2015-1-14 16:57:10)

    目的条带为1468bp

    ===========================================================================================================

    这样的话就可以肯定,你的目的片段没有P出来,给你两个建议:
    1、确认template的浓度以及纯度
    2、调整反应体系以及反应条件,做几个梯度看看,说明书上的都是理论的东西,实际操作过程中,会受到很多因素的干扰,所以说明书只能做一个参考,只有自己在实验过程中得到的数据才是最真实的。
  • 小螺号 (2015-1-14 16:57:29)

    QUOTE:

    原帖由 yjf1026 于 2015-1-14 16:57 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')
    目的条带为1468bp

    ===========================================================================================================

    这样的话就可以肯定,你的目的片段没有P出来,给你两个建议:
    1、确认template的浓度 ...
    您好,您说的做几个梯度是指什么梯度?具体说下吧,谢谢!
  • qhyu (2015-1-14 16:57:46)

    目标条带分子量有点大,可采用其他PCR产品
  • 小螺号 (2015-1-14 16:58:41)

    QUOTE:

    原帖由 qhyu 于 2015-1-14 16:57 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')
    目标条带分子量有点大,可采用其他PCR产品
    其他PCR产品,能不能再指明点,谢谢!
  • xue258 (2015-1-14 17:04:37)

    就是有些PCR试剂盒嘛~~最普通的只是1000bp以内,中等的是1000至3000bp,长的3000以上~~具体好像罗氏的也有~~高保真之类的。。。不过你先试试最普通的啦~~
  • qiangren789 (2015-1-14 17:05:04)

    其实你的菌液鉴定结果应该基本都是阳性,Marker2000  1000--2000之间的若隐若现的带应该就是,但是目的带 ...

    =================================================================================

    不一定吧,如果我转化进感受态的话,假阳性是很多的~~那时郁闷死我,还好~~我只要一个阳性细菌就好了~
  • u76mp (2015-1-14 17:05:31)

    一看跑出来的胶图片就知道你挑的菌落全部是阴性。。。。如果你的引物没有问题的话,还有模版加1微升就足矣!!
  • yueban-1147 (2015-1-14 17:05:52)

    引物已经形成二聚体了,丢那星星
  • qqq111 (2015-1-14 17:06:09)


    貌似全是引物二聚体呀
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