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Nature:George Church突破性成果,给转基因“上保险”

2015.1.22

  转基因生物和人造生物总是让人欢喜让人忧。现在,科学家们已经在用这些生物生产胰岛素等药物成分、开发生物能源、研究人类疾病和改善传统农业。尽管转基因生物的风险有被夸大之嫌,但转基因逃逸的确可能扰乱自然的生态系统。

  光靠物理防范显然是不够的,因为实验室器具和工业设备可能破裂,工作人员也可能无意中把被污染的衣物带回家。而且有些转基因生物就是在开放环境下使用的,比如旨在阻断疟疾的转基因蚊子。因此,科学家们致力于打造牢靠的生物防范措施。著名遗传学家George Church教授就在这方面取得了突破性的成果。

  2013年George Church领导哈佛医学院的研究团队重新编码了大肠杆菌的基因组。这是世界上首个基因组被重新编码的生物,而这种生物需要受到严格的控制。

  现在Church的研究团队解决了这个问题,他们进一步改造了这个E. coli菌株,将一种人工合成的氨基酸整合到基因组的多个位点。缺乏这种氨基酸,细菌就不能将RNA翻译成正确折叠的蛋白。这种人造氨基酸不存在于自然界中,E. coli本身也无法合成它,只能从特殊的人工培养基中获得。这一成果发表在一月二十一日的Nature杂志上。

  Nature杂志同时还发表了另一个团队的研究成果,他们通过另一种方法使E. coli菌株依赖于人造氨基酸。这个团队的领导者是与Church长期合作的耶鲁大学的Farren Isaacs。这两项研究首次将人造营养物质作为生物防护手段,这样的策略可以确保转基因生物在开放环境下的安全性。

  “就基因组功能而言,这是迄今为止人们对基因组做出的最大改动,”Church说。

  Church的研究团队还让这种E. coli抵抗了两种病毒,并准备进一步扩宽它的抵抗范围。这种设计能让E. coli更加安全,因为病毒感染不仅会造成很大的经济损失,还可能引起生态问题。

  锁住转基因

  为了确保这种E. coli的安全性,研究人员对其基因组做出了49处改变,使其依赖于人造营养物。某个细菌随机抵消所有这些改变,同时不获得有害突变,这种可能性是相当低的。

  目前这种E. coli的逃逸率(不依赖人造氨基酸存活)“低到无法检出,”Church说。研究人员总共培养了一万亿E. coli细胞,两周之后无一逃逸。“这比NIH推荐的转基因生物逃逸率好一万倍,”Church说。

  研究人员重新设计了三个基本蛋白,获得了两个依赖性的E. coli菌株。“同时使用三个蛋白威力更强,”Church说。他预计,未来用更多人造氨基酸改造E. coli,可以完全抹杀转基因逃逸的可能性。

  Church的这种方法是否存在缺陷,还有待于时间的检验。就目前而言,他对自己团队的结果很满意。

  作者简介

  著名遗传学George M. Church是哈佛医学院的遗传学教授、Wyss研究所的核心成员。他被誉为是个人基因组学和合成生物学的先锋。1984年,Church和Walter Gilbert发表了首个直接基因组测序方法,该文章中的一些策略现在仍应用在二代测序技术中。此外,如今的多重化分子技术和条码式标签也是他发明的。Church还是纳米孔测序技术的发明者之一。

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