确保沂河、沭河及两河流域的水质，加强对上游客籍水质监控，做好污染防范，维护江苏省新沂市及下游地区水环境安全，江苏省环保厅于2009年同意新沂市在沭河、新墨河省界处分别建设水质自动监测站，用于监控沭河和新墨河入境水质状况。
目前，两站主体工程已完工，省厅调拨价值400多万元的仪器设备已到位安装调试，并开机使用。水质自动监测站自动监测每天的水质情况，测试项目为水温、电导、浊度、溶解氧、氨氮等。
监测站采用自动化操作，平时24小时出6次数据，出现紧急情况时，则每两小时出一次数据。检测结果直接传输到水质监测中心信息平台，一旦发生污染事故，监测系统会迅速报警，自动监测站还可对沂河、沭河上下游水质起预警作用。新沂市环境监测站站长黄志伟说:“以往对水质进行采样调查，通常几天才能进行一次。水质监测站的建成，结束了新沂多年水质监测采用传统手工采样监测的历史，大大提高了环境水质自动监控能力，更加全面、客观、真实地反映新沂水质的变化情况。”