PNAS：病毒小RNA抑制登革病毒复制
每年有超过100个国家报道了近100百万例登革病毒(Dengue virus，DENV)感染性疾病，包括50万例登革出血热。伊蚊属的埃及伊蚊(Aedes aegypti)和白纹伊蚊(Aedes albopictus)是DENV的主要传播者。MicroRNA(miRNA)是一类具有调控功能的小RNA，在众多的细胞过程中发挥重要作用。在宿主和病原体间无休止的“军备竞赛”中，病毒也会编码miRNA帮助其成功的侵染。为寻找DENV编码的功能性miRNA或病毒小RNA(vsRNAs)，来自澳大利亚昆士兰大学的研究团队采用小RNA测序技术对DENV侵染的A. aegypti中的小RNA表达谱进行了深入挖掘和功能分析*，研究成果发表在近期的PNAS上。
研究人员首先构建了2个小RNA文库，分别来自DENV侵染的A. aegypti和对照的A. aegypti，并用高通量测序技术分析其中可能来自DENV编码的小RNA(小RNA测序项目由联川生物承担完成)。测序共发现了484条不同长度分布的vsRNAs，筛选出了6个vsRNAs，它们的候选茎环结构位于病毒基因组RNA的5′与3′非翻译区。为找出这6个vsRNAs对病毒RNA复制的影响，研究人员合成了与之对应的inhibitor进行抑制实验，结果发现只在抑制DENV-vsRNA-5时，会导致病毒复制的显著增加。通过沉默RNAi/miRNA 通路相关的蛋白，发现Argonaute 2主要参与了DENV-vsRNA-5的生物合成。通过前体茎环的克隆，免疫共沉淀，对RNAi通路缺陷C6/36细胞(来自A. albopictus)以及哺乳Vero细胞系(非洲绿猴)中病毒小RNA检测和分析，均证实了DENV-vsRNA-5的存在。不仅如此，通过分析DENV-vsRNA-5的 mimics和inhibitor对DENV RNA表达水平的影响，也揭示出DENV-vsRNA-5在病毒自我调节中的作用，该小RNA可靶向调控DENV的非结构蛋白1基因。值得注意的是，来自 DENV血清型1和4，而非3的DENV-vsRNA-5同源mimics可以抑制DENV-2的复制。
上述研究结果表明，DENV可以编码功能性vsRNAs，其中的一个病毒小RNA，有类似于miRNA的功能，可以特异地靶向调控病毒基因。这为未来使用小RNA抑制DENV复制开辟了一条新途径。
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