根据国务院关于开展重大专项监督评估的有关部署和中纪委、中央加快转变经济发展方式监督检查工作领导小组的统一要求，科技部会同发展改革委、财政部三部门7月底组织启动了对民口10个重大专项实施及其经费管理使用情况的监督评估。在各部门、各专项紧密配合下，在监督评估组专家的辛勤努力下，2011年监督评估工作已顺利完成第一阶段工作。
在去年监督评估工作基础上，今年继续按照电子与信息、能源与环保、生物与医药和先进制造等四大板块，组织81位技术专家、管理专家和财务专家，成立了4个以资深、权威专家为组长的监督评估组，对民口10个重大专项进行监督评估。目前，2011年重大专项监督评估已经完成了动员启动、专项自查、视频汇报、座谈调研和实地调研等环节工作。一是开展自查，初步掌握专项整体进展情况。6月26日，科技部下发通知要求各专项开展自查，形成自查报告。8月3日-8月11日，监督评估组听取各专项牵头组织单位的自查汇报。在此基础上，结合各板块和专项实际，确定了实地调研、视频汇报的重点项目(课题)，以及关键评估议题和初步日程安排。二是积极动员，全面部署今年监督评估工作。7月25日，三部门召开动员会，传达中央纪委、中央加快转变经济发展方式监督检查工作领导小组的指示精神，全面部署2011年监督评估工作。为切实做好财务检查工作，科技部还组织召开了监督检查财务专家培训会。三是视频汇报，广泛了解项目(课题)进展情况。8月16日-19日，监督评估专家组听取了14个省市承担的329个项目(课题)的视频汇报，初步了解了专项实施进展和组织管理情况。四是实地调研，深入了解实施进展和经费管理使用情况。8月下旬至9月下旬，各监督评估实地考察了12个省、市、自治区的126家单位;围绕专项顶层设计、核心共性关键技术攻关、组织管理等议题召开了71个座谈研讨会;重点检查了341个项目(课题)，并对160个重点实地调研项目(课题)进行了现场反馈。截至目前，已编发了53期《监督评估快报》，报送中央纪委、三部门有关领导，各监督评估组以及各专项，对各项工作进展进行了及时报道。