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中外百余名科学家《科学》公布重要测序结果

2007.10.16


生物通报道:来自美国加州大学洛杉矶分校,法国巴黎第六大学(Université Paris 6),中国中山大学生物技术研究中心,比利时列日大学(University of Liège)等多处研究机构,由115名科学家的组成的研究团体,历经三年完成了莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)的基因组,并公布在了10月12日的《Science》杂志上。

莱茵衣藻属于绿藻门、团藻目、衣藻科,是一种单细胞真核鞭毛藻类,是研究多种生命活动(如光合作用、鞭毛组装、趋光性和生理节律等)的模式生物,与酵母细胞有许多共同的特征,素有“光合酵母”之称。它的遗传背景清楚,其基因组学研究已近完成,是目前唯一建立细胞核、叶绿体和线粒体三套遗传转化系统的生物材料。

作为植物和动物最后的共同祖先分枝的一员,莱茵衣藻基因组能为多细胞生物的进化和分离提供重要的信息。这种单细胞的藻类大约10亿年出现,是研究光合作用、鞭状体、和能动性的模式系统。莱茵衣藻基因数量大约为15000个,之前已知的不到2%,通过这项研究,科学家们获知了莱茵衣藻基因组的95%的序列。加州大学洛杉矶分校分子生物学研究院主任,已研究绿藻长达20年的生物化学副教授Sabeeha Merchant认为,“这就像是一本基因的字典”,“我们了解了单词,现在我们想要知道这些单词如何发音,没有这本字典,你就不能知道如何写如何读,我们都想要知道如何将这些单词和句子拼接起来”。

她还表示,“基因组测序结果能加快我们的研究,让我们快速获得研究进展”,“基因组序列为我们了解所有基因,以及研究靶标基因打开了一道门,这些是我们十年前的梦想,现在都可以实现了”。

在这项研究中,通过将莱茵衣藻基因组与其它已知的基因组进行比较,比如人类和开花植物。结果发现三者有35%的基因是共有的,仅莱茵衣藻与人类基因组共有的为45%,而仅衣藻与开花植物共有的为62%。 因此研究人员认为虽然这一绿藻与陆地植物的关系最近,但是它保留了与动物运动用的鞭状体和纤毛类似的基因和特征。Merchant表示,“这个单细胞完成了一些更复杂的生物机体所具有的生物化学行为,它们能游动,寻找食物,完成光合作用以及配对”。

莱茵衣藻可以像植物一样进行光合作用,研究人员也发现了可能在植物光合作用中起作用的基因,这是一个重要发现,因为研究生物修复和生物燃料的科学家对莱茵衣藻也十分感兴趣。

研究人员在这项研究中共识别了349个存在于绿藻和植物,但是人类和其它动物中没有的基因,令人惊讶的是其中200多个基因功能未知,Merchant说,“大部分基因功能未知,这是令人激动的一个发现”,她还表示科学家们怀疑这些基因中许多都属于光合作用过程。

除此之外,研究人员还确定了与衣藻鞭毛(flagella)相关的蛋白,这将加深科学家对人类大脑等部位的纤毛(cilia)的理解和认识,并为纤毛缺损导致的人类疾病研究开辟新的途径。

这项研究包含了来自美国,法国,中国,日本,德国,澳大利亚等多国研究人员,文章的共同作者为分别来自美国能源部联合基因组研究所(Department of Energy's Joint Genome Institute,DOE JGI)和华盛顿卡耐基研究院的Simon Prochnik和Daniel Rokhsar。


近期《自然》、《科学》杂志先后刊登了三项重要的基因组测序结果。被测序物种包括了植物、寄生虫和远古动物。

《科学》:毛发助科学家测定猛犸基因序列

丹麦和美国的科学家近日利用来自俄罗斯冻土带的十头猛犸(Mammuthus primigenius)毛发标本,成功拼凑出了猛犸的线粒体DNA序列。这一成果显示了毛发惊人的抗降解能力,以及它在获得远古DNA片断方面出人意料的有用性。相关论文发表在9月28日的《科学》杂志上。

《科学》:象皮病寄生虫的基因组

生物学家制作了第一个寄生蛔虫的基因组草图,它将成为研究象皮病的药物和疫苗的重要工具。Elodie Ghedin和同事测出了马来丝虫(Brugia malayi)的大部分基因组,这个线虫给热带地区发展中国家中上百万人带来患象皮病的威胁,该寄生虫妨碍被感染人的淋巴系统,导致组织肿胀和皮肤变厚。现在,科学家能比较马来丝虫的基因组与独立生存的蛔虫、以及模式生物美丽线虫的基因组,来识别与寄生有关的基因。马来丝虫有一个复杂的生命周期,涉及到两个宿主。这两个宿主的基因组也已测出,研究人员也许能发现寄生虫在这些宿主身上的薄弱环节,从而找到控制该疾病的全新靶标

《自然》:葡萄的基因组测序完成

法国科学家宣布,他们完整地测定出一种酿酒葡萄的基因组。这是科学界首次成功破译水果类植物的基因组。尽管研究结果不会增加葡萄酒酿造的神秘性,但科学家们相信,它将有利于改进葡萄酒香味,以及提高葡萄对疾病的抵抗力。

原文检索:
Science 12 October 2007:
Vol. 318. no. 5848, pp. 245 - 250 DOI: 10.1126/science.1143609
The Chlamydomonas Genome Reveals the Evolution of Key Animal and Plant Functions
【Abstract】

 

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