【求助】如何寻找某个基因序列的糖基化位点?

我现在有一个序列,但我不知如何找出它的糖基化位点?请教了,谢谢!!
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  • wanglaoshi (2016-2-09 22:31:35)


    氮糖基化的规律:出现N-X-T/S序列可以认定是氮糖基化位点。X代表任意氨基酸。
    氧糖基化迄今尚无规律可循。
  • 33号 (2016-2-09 22:31:51)

    首先建议你最好将“基因序列”改成蛋白序列。
    如果你想预测某蛋白序列是否存在潜在的糖基化位点,可以到如下网站去在线预测:
    1.NetOGlyc - Prediction of O-GalNAc (mucin type) glycosylation sites in mammalian proteins
    cuturl('http://www.cbs.dtu.dk/services/NetOGlyc/')
    2.NetNGlyc - Prediction of N-glycosylation sites in human proteins
    cuturl('http://www.cbs.dtu.dk/services/NetNGlyc/')
    3.YinOYang - O-beta-GlcNAc attachment sites in eukaryotic protein sequences
    cuturl('http://www.cbs.dtu.dk/services/YinOYang/')
  • mickeylin (2016-2-09 22:32:14)


    我是一新手,我想问一下,糖基化位点又意味着什么???多谢!!
  • mickeylin (2016-2-09 22:32:58)

    QUOTE:

    原帖由 33号 于 2016-2-9 22:31 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '')
    首先建议你最好将“基因序列”改成蛋白序列。
    如果你想预测某蛋白序列是否存在潜在的糖基化位点,可以到如下网站去在线预测:
    1.NetOGlyc - Prediction of O-GalNAc (mucin type) glycosylation sites in mammalian prot ...
    但是我测了一个基因序列,没有完整的ORF,不能翻译成完整的氨基酸。请帮忙!!多谢!!
  • mickeylin (2016-2-09 22:33:27)


    请问yioyang中的yinyang代表什么??多谢!!