美国马里兰大学医学院基因组科学研究所(IGS)近日获得美国FDA的一份研究项目合同,利用两种高通量测序技术对细菌病原体进行测序、组装和注释,以支持公共参考数据库的扩展。

  据介绍,这个项目将持续两年,目标是产生序列草图,让其他研究人员能够用来开发和评估基于NGS的体外诊断,以鉴定病原体。

  根据这项合同,IGS基因组资源中心的研究人员将利用两种高通量测序平台,Illumina和Pacific
Biosciences,以及多种基因组组装软件包和组装QA/QC pipeline,来组装和验证所产生的基因组序列草图。

  Illumina测序仪是目前市场上使用最广泛的测序平台,通量高,准确性好,但读长不太给力。 PacBio RS
II测序仪经过升级,平均读长达5,000 bp,最长读长超过20,000
bp。研究人员认为,通过使用这两种互补的测序平台,他们能够交叉验证共有序列,带来有可能最高的序列准确性。