总之，Fastq是当前最为主流认可的序列数据存储格式，不管哪一代测序技术，什么样的原始数据，都免不了要打上Fastq格式的烙印，Fastq文件的格式及使用已经成为高通量测序学习中当仁不让的第一站。 ...
质量控制在高通量测序中，有时候会出现低质量读数和污染读数等问题，会影响接下去的分析结果。因此，质量控制（QC）对于原始NGS数据至关重要。现在质量控制软件主要用的是 NGS-QC Generator，它可以从与特定NGS概况相关联排序读数的分布推断出质量指标。基因组对齐高通量测序分析中需要将生成的读数对准（映射）到参考序列。此时，就需要用到Bowtie和BWA。...
也包括来自于差异显示和RACE实验的cDNA序列。 5. GSSs - 基因组调查序列，短的、单次（测序）阅读的cDNA序列，exon trap获得的序列，cosmid/BAC/YAC末端，及其他。 6. HTGs - 来自于大规模测序中心的高通量基因组序列，未完成的（阶段0，1，2）和完成的（阶段3）序列。...
本文件涵盖法医DNA分型技术、高通量测序技术，或其他基于短串联重复（STRs，包括常染色体、X染色体、Y染色体）、线粒体DNA、单核苷酸多态性（SNP）等遗传标记分析。 一个对象的单一DNA分型数据记录可能需要使用多种DNA分析技术产生的数据。本文件确保了一个对象由多个DNA分析技术产生的数据能够集成在一个记录中。 这种数据格式是为了减少DNA处理过程中（登记和比对）的人工参与。...
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