实验室的新玩具——Ion Torrent

　　今儿的话题，懂得人不屑于看，不懂得不会有兴趣看。。纯粹是自己的学习＋记录了。

　　很早以前就读过Nature上那篇《Next Generation DNA Sequencing》,当时的感觉是我擦真牛B～DNA直接跟珠子上扩增成簇富集然后进行下一步的合成测序反应，但是脑子里一点概念也没有，珠子为何物？多大？长啥样？DNA咋跟上面长？仅仅靠读paper简直有盲人摸象的感觉。。直到实验室的新玩具Ion Torrent到货以及培训。

　　昨儿下午介绍了下理论，还挺有意思，机器工作的原理是上面提到的珠子富集DNA以后，是通过检测新加上的单一碱基合成反应中释放的H+离子，然后将化学信号转换成电位信号从而检测序列的。读长大概是100－200bp,根据芯片不同可以一次产生10M-1G的数据。

　　今天一整天的实验培训，跟着后面屁颠屁颠的看，Ion Torrent的造型太酷了，充满设计感，于是乎抓起相机猛按。。。

　　接下来是看图说话～

　　Step1. Emulsion PCR ，这东西其实就是一个PCR仪，和普通的机子不同之处就是反应不再离心管里进行，而实在左上角的一个板子里，先将文库啊，酶啊，buffle啊，珠子啊（珠子其实就是物理的珠子，应该是纳米级别的，一个珠子通过浓度控制，只结合一段DNA序列）啥的加好，放到左上角，然后开机，机器会将其一滴滴的点到一个板子里进行PCR反应，在这个反应里，珠子上的单个儿DNA片段就会扩增富集成簇。最后反应后的液体会导出到右下角的试管里。

　　反应时间：4h

　　Step2：将之前得到的珠子进行分离，将没有结合DNA的珠子洗脱。这个仪器说白了就是一个机器手。。。按顺序把下面的液体混合，原理是，之前珠子上的测序引物上结合有一种生物素，然后这一步里用到另一种珠子，上面结合有链霉素可以与之前的生物素结合，然后没有结合的（即没有DNA的珠子）就被洗没了。。。

　　时间：40min.

　　Step3：这就是最终Boss测序机器了，那个像机器猫时光机器的东西就是用来搁芯片的，将处理好的珠子点到芯片里，一个珠子就到了一个微孔里，行程一个反应池，测序反应就会在里面进行，加一次dNTP就会记录一次数据。。。

　　配套的试剂盒也都够有爱的。。。绿色的是测序Kit.

　　这个设计的人一定是PS爱好者。。。看着就让我有种想搓的冲动。。。