基于几何不变量的蛋白质三维分子结构比对

上一篇 / 下一篇  2008-12-28 20:22:09/ 个人分类：蛋白质

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摘　要: 为了解决蛋白质三维结构比对需要处理大量的旋转、平移变换,直接用动态规划将变得十分繁琐这一问题,在保留蛋白质空间结构属性特征的基础上,对蛋白质三维数据进行了预先的处理. 通过计算蛋白质结构在旋转和平移下的几何不变量,将蛋白质的三维结构坐标变换为具有旋转、平移不变性的一维序列. 进一步给出了“距离”以及“相似得分”的定义. 在此基础上采用动态规划方法给出了新的蛋白质结构比对算法. 对专家分类的蛋白质结构数据库进行测试,结果显示准确、快速.



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TAG: 蛋白质结构比对相似分值动态规划

 

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