丹枫节学生论坛：蛋白质组后修饰的研究

发布于2007年5月15日

本期论坛很荣幸的请到了近期回国的张国安师兄和余巍同学为大家讲座。

张师兄目前在纽约大学医学院从事疾病蛋白质组学的研究，他给大家简介了他的磷酸化标记定量研究，主要分以下几个方面：一是基于QToF的磷酸化蛋白SILAC标记定量研究，得到了RTK通路中的Eph受体等重要功能蛋白的上调下调信息。二是实验流程的设计和误差分析。张师兄的实验分析了IP，SDS-PAGE，酶解，质谱数据分析等步骤的误差，以及平行实验对总体误差的影响。张师兄的实验表明：IP实验和SDS-PAGE 6次平行的实验和3次平行实验的差异不大，酶解只做一次就可以了，另外IP和质谱数据的分析的误差是实验误差的主要来源。三是用DNA maker指导SDS切胶规避蛋白含量过低带来的切胶困难。

余巍同学从全局的角度把乙酰化蛋白的研究做了一个综述，包括了乙酰化组蛋白和乙酰化其他蛋白的乙酰化。由于乙酰化抗体的低亲和力和[14C]-CoA的放射性比较低，乙酰化蛋白的研究相对其他修饰蛋白的研究遇到了更大的困难。