用TripleTOF 5600高分辨质谱的Profile工作流对多肽同时定性和定量

摘要：基于质谱数据的蛋白质定量分为两类：基于同位素标记的MS/MS扫描或者MRM扫描和基于非同位素标记的MS扫描。运用TripleTOF 5600系统，首次能将所有的蛋白质定量流程在单一的平台上完成。TripleTOF 5600系统集高灵敏度、高分辨率、高扫描速度、高质量准确度于一身。针对MS扫描，TripleTOF 5600拥有高分辨、高质量精度的飞行时间质谱性能，具有较宽的动态范围可鉴定中等复杂生物样品中的肽段；与此同时，TripleTOF 5600还具备高分辨、高灵敏的MS/MS快速采集速度，从而对样品进行深入表征。这种完美的结合使得TripleTOF 5600系统在一次进样完成对肽段同时定性和定量。

实验仪器

Eksigent nanoLC-Ultra 2D 系统

TripleTOF 5600

QTRAP 5500

MultiQuant 软件

结论

通过实验可得到：在中等复杂的样品中，TripleTOF 5600系统运用Profile工作流程可提供同三重四极杆相媲美的定量性能。对含5种目标肽段及同位素标记肽段的蛋白质组学定量标准分析，结果比预期的轻/重肽段比定量精度高。