用 GenomeLab™ GeXP 遗传分析系统进行基因测序

DNA 测序

对其他系统无法测量的区域进行测序

您会选择一项超乎想象的强大技术以找出导致序列失败的可能原因吗?
尽管可以调查出导致序列失败的可能原因,但是很多情况下无法这样做。调查问题总会让人困惑、令人沮丧且耗费时间。最好的解决办法是从一开始就采用优质的技术来提高实验室的性能。主动出击才能掌控未来。

对其他系统无法测量的区域进行测序
GenomeLab™ GeXP 遗传分析系统采用独特的 DNA 测序试剂 - 包括线性聚丙烯酰胺 (LPA) 凝胶、涂层毛细管、脱氧鸟苷三磷酸 (dITP) 化学、脱氧鸟苷三磷酸 (dGTP) 化学和花青(近)红外染料 - 以及联机变性功能。这样可以减少修正,提供更有意义的原始数据,实现更高质量的最终分析。因此,GenomeLab™ GeXP 遗传分析系统能够解决其他系统无法解决的复杂序列问题,以高质量的序列填补缺口。

在本例中,我们将 GeXP 遗传分析仪系列与另一个自动测序系统进行比较,对比两款系统在完成一个棘手的人类基因组序列区中的表现。另一个系统无法解决的一段序列通过 GeXP 系统的创新化学反应得以完成。

通过末端标记循环测序 (DTCS) 确定基因组串联重复序列

末端标记循环测序

GenomeLab GeXP 是一款全自动遗传分析系统,在市售的所有测序平台中具有最佳的分析性能。这款系统通常能在 30 分钟之内完成 200 个核苷酸测序,在 50 分钟之内完成 600 个核苷酸测序,并且在读取长度超过 800 个碱基对的序列时,准确度达到 98% 以上。

GeXP 在此过程中采用末端标记循环测序法。循环测序法利用热循环仪内一轮轮的变性、退火和延伸实现对延伸产物的线性扩增。这些测序方法非常强大,需要的模板数量远远低于单一温度方法所需的数量。

利用染料末端标记,四个双脱氧终止子均使用不同的荧光染料标记。生长链同时终止且采用与其碱基对应的染料进行标记。借助这种方法,您可以使用未标记的引物,在同一个管内完成所有反应,在同一个毛细管内对四种颜色进行评估,且由于没有染料标记,假停止不会被发现。

自动碱基识别 
GenomeLab 序列分析软件会自动识别每个碱基并对每次识别指定一个置信度值,便于您立即评估序列数据的质量。

序列分析包括信号处理、碱基识别和确定各个已识别碱基的置信度值。无需通过校准补偿光谱重叠或染料间的流动性差异。双通道碱基识别系统首先会找出有效峰值,然后运用靶向图技术1来优化识别的碱基序列。最后,估算识别的碱基的出错概率,并确定质量值。

自动杂合子检测
确定杂合子碱基在基因组 DNA 中的位置对于定位二倍体生物中的突变或多态性具有重要的实用价值。DNA 测序是最终确认在一个单核苷酸位置是否存在不止一种碱基。

GenomeLab 软件允许用户从序列分析参数编辑器切换到自动杂合子检测。

运用 IUB 标准命名法自动检测和确定杂合子。这种机制可以快速突出序列数据内的多态性或突变。

运用 GenomeLab 控制和分析软件自动确定多种杂合子

自动修剪
注意 - 基于匹配用户输入序列信息(基于序列的修剪)或根据质量值(基于质量的修剪)执行修剪功能。

多种分析功能

  • 自动碱基识别,并在完成每行八个样品后自动生成报告
  • 用于碱基识别算法的可编辑参数集
  • 音频播放选定的 DNA 片段
  • 针对每个序列生成的识别分和质量值以及基于质量的修剪可以保证碱基识别质量
  • 导出功能便于第三方数据分析(.scf、FASTA、PHRED、SEQ、Tab 分隔)


对于所有研究人员而言,这种技术都是一种理想的分析技术,可以帮助您达成目标。让我们演示我们的技术如何帮助您,立即请求样品分析。