采用多模式电离质谱策略解读代谢组学的复杂性

Nordström A, Want E, Northen T, Lehtiö J, Siuzdak G. Anal Chem. 2008 Jan 15; 80(2): 421-9. Epub 2007 Dec 18.

摘要：本文介绍了一种分析人血清提取物的多模式质谱策略。将色谱分离与正、负离子两种模式的大气压电离技术— 电喷雾电离(ESI) 和大气压化学电离(APCI) 在线联用。另外，还通过组分收集和离线质谱法，将分离与表面基质辅助激光解吸附/电离(MALDI) 和多孔硅表面解吸附质谱(DIOS) 结合。用XCMS 软件对原始数据进行处理，得到与时间对应的离子特征，定义为特定保留时间的特定m/z。通过对比ESI 和APCE+/- 模式所获得的LC/MS 离子特征列表，得到特征离子列表。将非冗余的特征离子定义为，在相同保留时间内用其它电离方法未观察到[M + H](+)、[M - H](-) 或[M + Na](+) 离子的质量数。用ESI+/- 两种模式分析血清提取物，可以使(-) ESI 模式检测到的额外特征离子增加90% 以上。用APCI 辅助ESI 分析，可以使特征离子数增加20%。最后，将ESI/APCI 电离与馏分收集和离线-MALDI 和DIOS 质谱法相结合。将LC-MS 总离子流色谱中相当于收集的馏分的各部分加总，将得到的m/z 列表与DIOS/MALDI 质谱图所得到的m/z 列表进行比较。可以看出，每个馏分DIOS 能检测到的特定离子约占50%。结果表明，真正全面的代谢组学，需要采取多种电离技术，以解决固有的代谢物多样性造成的代谢组学研究的复杂性。