总体exo代谢组学分析的跨平台Q-TOF 验证:应用于标准PI 3-激酶抑制剂LY294002 处理的人胶质母细胞

Pandher R, Ducruix C, Eccles SA, Raynaud FI.J Chromatogr B Analyt Technol Biomed Life Sci. 2008 Dec 6.[Epub ahead of print]

摘要:评价了检测肿瘤细胞代谢物变化的一种代谢组学方法的重现性。在安捷伦和Waters LC-Q-TOF 仪器上用反相色谱分析了组织培养基提取物,色谱柱为Waters Acquity T3 柱,用0.1% 甲酸:乙腈13 分钟梯度洗脱。用MarkerLynxtrade mark (Waters) 和Molecular Feature Extractor(安捷伦)软件提取正离子和负离子模式的特征离子(m/z, RT)。两个仪器上得到的特征离子数相近,10 次分析的重现性变异<35%,以正/负离子模式检测的所有离子的信号变异分别约为50% 和40%。添加到基质中的外标其峰面积的日内及日间变异<25%。87MG 胶质母细胞在PI 3-激酶抑制剂LY294002 的作用下,几种已证实的特征离子呈明显变化。其中包括甘油磷酸胆碱,已由NMR 证明其受LY294002 调节,说明这项技术具有发现生物标志物的能力。