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ABI拓展新一代测序平台在基因表达研究的应用

发布: 2008-05-01 20:45:51来源: SCIEX

利用全新的小分子RNA研究方案进行更多新实验 以深入了解关键的生物和疾病过程。

就在近几年,科学家才开始逐渐了解非蛋白质编码的小分子RNA在活细胞中的作用。科学和技术的突破表明,这类新发现的调节分子在细胞生理过程中起到关键作用,有助于深入理解基本的生物学和诸如癌症等复杂疾病过程。现在,来自Applera集团旗下的ABI公司(Applied Biosystem)为研究人员提供了基于ABI新一代基因组分析技术的全新研究工具,用于发现microRNA和其它小分子RNA。

ABI公司今天宣布推出全新SOLiD RNA表达解决方案,进一步拓展ABI新一代测序平台的高灵敏数据化基因表达分析解决方案。新产品包括一个全新的样品制备试剂盒,可实现在无需预先知道序列信息的情况下高通量发现新的RNA分子。这个方案有望显著地提高研究人员鉴别小分子RNA的能力,将过去不可能完成的实验变为可能。

SOLiD小分子RNA表达试剂盒(SOLiD Small RNA Expression Kit)为研究人员提供了一种全新的工作流程,能极大地减少小分子RNA库制备过程所需的时间、成本和实验偏差。这个试剂盒将总RNA转换为适于插入SOLiD System工作流程的文库,以便进行高通量的基因组分析。这种简单的实验方法,可将样品制备工作从常规方法的四天(其他平台)缩短为仅需一天,因而有望促进研究人员改进与小分子RNA相关的生物学变化的检测。它也仅需极少量的样品,使过去因为RNA样本量不足而无法用其他方法进行分析的研究,如今借助SOLiD也得以开展研究。这个新的样品制备试剂盒目前可以通过“优先使用计划”获得。

一旦用SOLiD系统发现了小分子RNA,研究人员就可以使用ABI业界领先的TaqMan(R) Assays来验证研究结果,或者集中研究感兴趣的特定microRNAs。ABI提供microRNA分析的完整工作流程解决方案。ABI几天前也宣布,它已经启动Custom TaqMan MicroRNA Assays的“优先使用计划”,以帮助研究客户发现新的microRNAs。

马萨诸塞大学医学院教授Vitor Ambros博士致力于小分子RNA研究的前沿领域,他是到目前为止优先使用SOLiD Small RNA Expression试剂盒的十几个用户之一。Ambros博士将这个试剂盒和TaqMan microRNA Assays联合使用,研究microRNA在癌症中的作用。

“这是一项真正的革新性技术。它让科学家能够以前所未有的简单方式进行之前无法想象的实验”,Ambros博士说,“据我个人的经验,与我过去用过的技术相比,这个试剂盒所需的单个样品量至少要少10倍,实验操作步骤也少得多。今后,这种简单直接的方法将使更多的科学家得以进行这些类型的研究”。

目前已发现的microRNAs还不到800个,但技术的进步----例如SOLiD System,有望揭示更多新的有科研价值的小分子。因为SOLiD System可在不知道目标分子DNA序列的情况下进行检测和定量小的RNA分子,所以它是分析在生物样品中表达的已知和未知miRNA及其它小分子RNAs的有效工具。

“SOLiD System是基因表达分析的完美之选,因为它提供了业界最高检测通量,拥有检测低水平表达的基因和检测低丰度分子的变化所需的高灵敏度”,ABI公司SOLiD基因表达策略的主管Roland Wicki说,“有了这个新的小分子RNA表达试剂盒,我们就可以将SOLiD系统的基因表达分析之应用范围扩展到所知甚少但又极其重要的小分子RNA上”。

ABI是全球生命科学市场仪器系统、消耗品、软件和服务等方面研发和销售的领头企业,公认商业化DNA测序平台的市场领导者。ABI为非编码RNA的研究提供最全面的解决方案,产品包括小分子RNA的发现、表达分析和定量,以及siRNA进行基因敲除、敲除验证和样品制备等。ABI通过不断将其先进的技术商品化应用以帮助科学家在基因组信息基础上更好地了解和治疗疾病,从而继续保持在DNA测序领域的领袖地位。SOLiD系统在高通量、精确性、应用灵活性和延展性方面为新一代遗传分析平台建立新标准。

SOLiD System是一个端到端的新一代基因组研究方案,包含测序组件、化学组件、计算集群和数据存储组件。这个平台基于通过寡核苷酸连接和检测进行测序。与聚合酶测序方法不同的是,SOLiD System利用专利的逐步连接(stepwise ligation)技术来产生高质量的数据,可应用于全基因组测序、染色质免疫共沉淀(ChIP)、微生物测序、数字核型分析、临床测序、基因型分析、基因表达分析和小分子RNA的发现等等。


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