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工商注册信息已核实!布鲁克在核酸药物杂质分析领域拥有完整的解决方案。该解决方案结合了超高效液相色谱(UHPLC),TIMS离子淌度高分辨质谱或QTOF高分辨质谱,以及Biopharma Compass合规软件等,在提供丰富核酸药物信息的同时,采用Biopharma Compass软件套装中的OligoQuest软件多样流程,可以多维定性定量核酸药物的预期及非预期杂质。
OligoQuest
>>OligoQuest autoMSMS流程
对主产物及预期副产物,通过完整分子量、同位素分布、碎片离子等信息进行确证,同时可通过LC-UV/MS图谱定量其纯度
>>OligoQuest targetedMSMS流程
对于低含量副产物及非预期副产物,该流程可提高鉴定深度。利用类似于MRM的分析策略以及高质量的MS/MS谱图,即使像U/C互换这样仅1 Da差异的不同副产物,也可以依靠布鲁克timsTOF或者QTOF高分辨质谱系统的同位素高置信度准确确证。
以24 mer经甲基化修饰的寡核苷酸实际样品为例(为书写简便,后文中其序列组成以a、c、g、u简写),我们来看如何利用OligoQuest软件进行寡核苷酸类药物的质量控制。
1. 主产物分析
通过OligoQuest autoMSMS流程,软件会自动给出主产物及预期副产物等的鉴定匹配结果,如分子量、质量精度、相对峰面积百分比、保留时间、序列覆盖度、MSMS匹配得分等信息(如下图)。
通过LC-UV/MS谱图,软件可自动给出主产物及副产物的相对峰面积百分比。如下图,9.28 min的主产物相对峰面积百分比是93.4%,而其它副产物相对峰面积百分比为0.7%-2.5%。
通过软件的同位素匹配功能(如下图),可将主产物的实测同位素分布与理论同位素分布,进行重合比对确证,并且也有助于观察是否发生C/U互换等。
对于序列确证,软件可以从5‘端(红色块)和3’端(蓝色块),在单核苷酸等水平,进行核酸序列的多维确证,相应的质量精度(ppm)在色块上直接进行了注释。对于红色或蓝色块,软件会依据相应的信号强度,以热图形式呈现不同深浅,从而引导用户对较弱的离子信息进行进一步确证。
相应每一个相关的MS/MS信息,都可以通过交互界面,查看原始谱图与理论谱图的对比(如下图示例,红色为理论预测,蓝色为实测谱图)。
与此同时,还可以在软件中设置多质量属性监控MAM模块,快速对样品进行质控。如下图,通过设置质量精度、序列覆盖度等5种质量属性,软件通过“红绿灯”形式快速告知相关质量属性是否通过测试。
2. 副产物分析
1) 预期副产物分析
对于有多种序列可能性的副产物,通过软件的序列确证功能可进行快速指认。如下图,对于发生a/g和a/c碱基互换的2个副产物,通过序列匹配度,可将其指认为a16g和a2c。
由此可见,通过OligoQuest软件中autoMSMS和targetedMSMS流程,可对核酸药物主产物、预期及非预期副产物进行准确的定性定量分析。targetedMSMS流程不但能增加序列分析的深度,也可以表征发生多步变异的副产物,从而帮助用户更加全面的掌握样品中副产物/杂质的信息。