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Mol. Plant. (IF:10.8) |让28种有机酸代谢物陪您“看透”植物胁迫机制

发布时间: 2020-04-10 19:03 来源:上海鹿明生物科技有限公司

编者按:
 

有机酸代谢组学分析目前已经被广泛地应用在生命科学研究中,不管是针对植物的抗逆性研究,还是在动物、微生物、细胞培养液等方面的研究都有着广泛的应用;其中有机酸代谢组学分析还是医学临床实践中常用且非常重要的一个检测项目。

 

本期,小鹿带来鹿明生物新品,采用GC-MSMS可鉴定的28种有机酸物质,重要!重要!重要!手快的赶紧收藏哦~~

 

28种有机酸物质检测
 

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有机酸检测样本类型
 

1、动物   组织、血清、粪便、尿液等
2、植物   根、茎、叶、花、果实等
3、微生物   细胞、细菌等
4、培养液   细胞培养液、植物培养液等 
 

下面分享一篇有机酸代谢组学分析在植物中的应用实例,本篇为发表在《Molecular Plant》的“利用代谢组学方法研究水稻化学多样性”的文章,其中在代谢组学分析表明了以有机酸等为主的变化代谢物,通过代谢谱分析描述特征基因方法在进行非生物胁迫下水稻生长的研究中扮演关键角色。

 

基本信息

材料:水稻

影响因子:10.812

发表期刊:Mol. Plant. 

主要技术:GC-MS代谢组学 LC-MS代谢组学    

 

中文标题:利用代谢组学方法研究水稻化学多样性

 英文标题:Using Metabolomic Approaches to Explore Chemical Diversity in Rice
 

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文章摘要

水稻含多种生物活性化合物,它关系到人类能量摄入总量的25%,是重要的资源。为了研究水稻中的代谢产物及其化学多样性,本篇基于质谱方法结合水稻代谢数据库对栽培水稻的代谢组学进行研究。本文总结了基于GC-MS代谢组学、LC-MS代谢组学、的糖类、有机酸、氨基酸、芳香族化合物、植物激素代谢组学研究,还介绍了水稻产生的极性、非极性代谢物的生物学特性和活性,并介绍讨论基于代谢组方法预测未知代谢物的结构的步骤。最后,实例展示了应用代谢物QTL分析和潜在代谢标志物识别的方法。这种通过代谢谱分析描述特征基因方法在进行非生物胁迫下水稻生长的研究中扮演关键角色。

 

方法流程

1.水稻品种代谢物全扫描
 

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图1 | 韦恩图分析品种代谢物

 

2.初级代谢产物和次级代谢产物在水稻代谢谱中研究
 

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图2 | PCA分析 得分图与载荷图

 

3.芳香挥发性代谢物和植物激素的进一步研究
 

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图3 | 代谢物结构鉴定

 

 

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本文是一篇综述性文章,总结了多种代谢组学方法在水稻研究中的应用进展,包括目前检测到的代谢物的类别、不同品种之间的代谢物差别、未知代谢物结构预测和解析的方法等内容。这些内容一方面让我们更加全面地了解水稻的代谢组学的研究内容及方法有更深入的认识;另一方面,通过实例展示代谢组应用方法,对于我们发掘代谢组技术在水稻乃至其它植物研究中的应用价值提供新的认识。

 

随着28种有机酸代谢组学物质的推出,鹿明生物在代谢组学的研究又上了一层台阶。同时,鹿明生物在代谢组学研究方面经过数年的沉淀,在全谱代谢组、靶向代谢组、拟靶向代谢组、脂质组等代谢组学平台建立了科学完善的体系和流程。并建立了自己的本地数据库,为更好地助力广大科研工作者的代谢组学而不断努力

 

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