【代谢组学文章精选】5篇文章、5本期刊、5种物种、总计影响因子：37分

编者按
 

继上期分享代谢组学在植物中的应用项目文章 | 代谢组学经典7篇高分文章精选，总计IF:56。运用代谢组学（metabolomics）对某一生物体组份或细胞在一特定生理时期或条件下的小分子（分子量小于1000Da）代谢产物进行分析，寻找出目标差异代谢物的研究实例。以实际案例给在植物方向代谢组学研究的老师提供了参考~~

代谢组学主要是以非靶向（Untargeted metabolomics）和靶向（Targeted metabolomics）代谢组学研究为主。本期小鹿依然以代谢组学研究为主导，分享代谢组学在动物研究中的应用实例：5篇文章、5本期刊、5种物种、总计影响因子：37分，助力您动物方向代谢组学的研究思路。

01：冠状动脉疾病综合代谢组学特征分析

材料：冠心病患者血清

主要技术：LC-MS全代谢组、靶向代谢组

期刊：J. Am. Coll. Cardiol.

影响因子：18.639
 

研究内容：

本文由中国药科大学齐炼文博士团队发表在《Journal of the American College of Cardiology》的文章。本文对来自四个中心的2324名疑似冠状动脉疾病（CAD）患者通过造影检查，通过对冠心动脉疾病的不同分组及交叉验证确定了代谢标志物，并利用来源不同的样本进行验证。

文章通过LC-Q-TOF-MS分析代谢图谱并进行分析。通过对CAD样本的交叉验证比较，共鉴定了89种差异代谢产物。改变的代谢途径包括降低的磷脂分解代谢，增加氨基酸代谢，增加短链酰基肉碱，减少三羧酸循环，以及减少初级胆汁酸的生物合成。作者还发现12个生物标志物AUC值可达0.938至0.996（n = 1,086），在测试阶段预测值为89.2％至96.0％（n = 933），外部集也达到85.3％到96.4％（n = 305）。本文在临床研究有较强的借鉴意义。

02：大黄鱼（Pseudosciaena crocea）鱼卵的磷脂组成和分子结构研究

材料：鱼卵

影响因子：5.399

发表期刊：Food Chemistry

运用鹿明生物技术：LC-MS脂质组学，GC-MS靶向代谢组学
 

研究内容：

本篇为鹿明生物合作客户福建农林大学食品科学学院陈丽娇教授课题组在《Food Chemistry》杂志发表的文章。该研究报道了Pseudosciaena crocea鱼（P. crocea）鱼卵中磷脂（PLs）种类和分子类型的研究结果。为了充分研究鱼卵的PLs轮廓谱信息，作者使用多种代谢平台，包括GC-MS和HPLC-ELSD分别分析了鱼子的脂肪酸组成和PLs种类，以及使用UPLC-ESI-Q-TOF-MS平台确认了鱼卵中PLs的分子类型。

作者利用气相色谱-质谱（GC-MS）和带有蒸发光散射检测器的高效液相色谱（HPLC-ELSD）分别分析了P. crocea鱼卵PLs脂肪酸的组成并鉴定了PLs种类。实验发现总PLs中磷脂酰胆碱（PC）、溶血磷脂酰胆碱（LPC）、磷脂酰（PE）和磷脂酰肌醇（PI）分别占76.36±0.62％、12.30±0.55％、9.12±0.02％和1.09±0.01％。此外通过超高效液相色谱-电喷雾电离-四级杆飞行时间质谱（UPLC-Q-TOF-MS）表征PLs的分子组成，共鉴定出共92种PLs，包括49种PC、13种PE、10种磷脂酸（PAs）、13种磷脂酰丝氨酸（PSs）3种磷脂酰甘油（PGs）、2种鞘磷脂（SMs）和2种磷脂酰肌醇（PIs）。

03：草鱼不同饲养方式对肉质的影响

材料：草鱼

主要技术：LC-MS普筛

期刊：GigaScience

影响因子：4.688
 

研究内容：

本文为华中农业大学水产学院李大鹏教授团队发表在《GigaScience》发表的文章。这篇文章对人工饲料和草料饲喂养草鱼的影响进行了全面的生理、生化和代谢组学研究，并将这些研究结果与肉质的具体参数(如脂肪积累状况、心肌纤维厚度和质地)联系起来。很明显，肉质参数和代谢组学因素是密切相关的。代谢水平上的肉质特异性差异不仅与体内脂肪积累有关，还通过直接影响肌肉脂质和碳水化合物代谢而影响其最终风味。

此外，从环境和营养的角度来看，与传统的人工鱼饲料相比，天然草料是较好的膳食脂肪酸和蛋白质来源，同时也能有效的降低鱼类疾病的概率。阐明了天然草料在饲养方面的优势，也为人工饲养的改良提供了新的方向。

04：鼠李糖乳酸杆菌GG通过依赖肠道菌群的抗炎作用减轻富马酸替诺福韦二吡呋酯诱导的雄性小鼠骨质疏松

材料：小鼠粪便             

影响因子：4.45

发表期刊：Therapeutic Advances in Chronic Disease

主要运用鹿明生物技术：LC-MS全谱代谢组学
 

研究内容：

本篇为北京大学口腔医院课题组在《Therapeutic Advances in Chronic Disease》发表的文章。该研究报道了补充益生菌可能对骨质疏松症有效，本文作为此项研究的先导对其中的影响机制进行了进一步的探索。

本文旨在探索益生菌（LGG）改善骨质疏松症的作用机制。首先使用多种临床以及生理检测手段，对构建的5种小鼠模型进行检测，发现服用LGG确实可改善TDF引起的骨质流失，而且从临床角度观察到相关症状的改变。这些检测也从生理表型进一步确认实验模型的差异。为了进一步研究其作用机理，作者对LGG+TDF和TDF组进行了16S rDNA测序和代谢组研究，发现服用LGG可重构肠道微生物群、改变代谢物组成，并解释了相关机理。本文基于严谨的实验设计、临床和理化试验及多组学联合分析（基因测序+LC-MS全谱代谢组学）的整体研究思路，十分值得借鉴。

05：非靶向LC-MS代谢组学方法对喂养支链氨基酸的猪的血浆和尿液进行代谢分析，以获得最大生长性能

材料：猪血浆、猪血清

发表期刊：Journal of Proteome Research

影响因子：3.78

运用技术：LC-MS非靶向代谢组学
 

研究内容：

本篇由丹麦奥尔胡斯大学从事动物研究的Elham A. soumeh以第一作者发表于《Journal of Proteome Research》的文章，在本次研究中运用LC-MS非靶向代谢组学确认与支链氨基酸摄入水平相关的代谢表型可能与动物生长性能有关。这是首次通过探索喂养不同BCAA水平的猪饲料的生物液体来鉴定其代谢表型可能与动物生长性能有关。

往期回顾

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