【盘点】13分的植物多层组学是怎么做的？看看这些科学家的研究~~

编者按：

目前多层组学整合分析技术，不仅被大量用在【胰腺癌、肝癌、前列腺癌】多层组学在癌症分型和治疗靶点中的应用中，针对医学领域也发表了不少高分SCI文章：【多层组学汇总】平均IF：22 高质量期刊文章，您值得拥有~。而且多层组学技术在植物的作用机理、调控机制、毒性作用机制、环境领域、农作物增产等都有着广泛地应用。

本篇小编通过对多层组学在植物中应用文章盘点，给各位正在研究或准备进行植物学研究的老师提供一些思路和研究方法~~

No.1 解析潮间带大型绿藻光系统I-捕光天线I复合物结构

基本信息

【材料】潮间带大型绿藻

【发表期刊】Nature Plants

【影响因子】 13.297

【运用技术】质谱测序（由鹿明生物提供技术支持）

文章摘要

本文由济南大学、中科院植物所与清华大学合作发表，报道了一种潮间带大型绿藻（假根羽藻，Bryopsis Corticulans）PSI-LHCI 超分子复合物的3.49Å 分辨率的冷冻电镜结构，进一步完善了对光合生物进化过程中 PSI 结构变化趋势的理解；从进化与光环境适应的角度揭示了捕光天线复合物的捕光设计机理；为揭示绿藻光合膜蛋白 PSI-LHCI 高效吸能与传能的机理奠定了坚实的结构基础；为人工模拟光合作用机理，为指导设计作物与提高植物的光能利用效率提供了新的理论依据和新思路。

NO.2 蛋白组与代谢组整合分析拟南芥硫苷合成酶干扰后的系统响应
 

基本信息

【物种】拟南芥叶片

【发表期刊】Mol. Plant

【影响因子】 10.812

【运用技术】iTRAQ、GC-MS全代谢组、LC-MS全代谢组

文章摘要

本文由美国佛罗里达大学博士SIXUE CHEN团队小组发表，以拟南芥为材料研究表明了RNAi对硫苷合成的明显干扰作用。代谢组学发现的主要是氨基酸、糖类、多肽和激素的一些表达变化。代谢组学与蛋白质组学数据有很强的相关性，经过整合分析之后发现了细胞通路/过程和硫苷代谢之间的紧密分子关系。本研究描绘了一个新的硫苷代谢的分子调控网络，为进一步了解芥子硫苷调控机制奠定了基础，有助于后续增强植物抗性和质量。

No.3 植物铀毒性机制的代谢、转录组分析和矿物质营养代谢研究
 

基本信息

【材料】蚕豆根系

【发表期刊】Journal of Hazardous Materials

【影响因子】 7.650

【发表时间】2019.10

【运用技术】UPLC-MS普筛、GC-MS普筛、转录组测序（以上技术由欧易/鹿明生物提供）

文章摘要

本文由欧易/鹿明生物合作客户西南科技大学环境与资源学院罗学刚教授团队合作发表，该文章作者通过整合GC-MS和LC-MS非靶标代谢组、转录组测序数据，对蚕豆根系在不同浓度铀胁迫下的微观结构、营养代谢等方面进行了全面而系统的研究，揭示了铀对植物根系的毒性作用机制。

No.4 C60富勒醇对铜协迫黄瓜叶片组织的蛋白及代谢组学研究
 

基本信息

【材料】黄瓜叶片

【发表期刊】Environmental Science & Technology

【影响因子】 6.6

【运用技术】GC-MS & iTRAQ技术(以上技术由鹿明生物提供)

文章摘要

本文鹿明生物合作客户南京大学赵丽娟老师合作发表。在此项研究中，C60富勒醇作为一种新型的纳米材料，理论上被认为可以用做外源的抗氧化剂，然而结果表明，C60富勒醇是可以增强铜的毒性的，可以通过增强黄瓜叶片中电子的传递速率从而增加铜进入植物细胞。进一步的研究发现C60富勒醇既可以触发植物中能量代谢的紊乱、产生大量的ROS，又可以通过诱导并激活植物的抗氧化反应机制来中和能量代谢紊乱带来的大量ROS。鉴于以上发现，后续在实际环境应用领域方面可以结合C60富勒醇这一系列的性质来进行持续性的开发及利用。

No.5 鸟氨酸δ-氨基转移酶通过介导氮素对小花发育和结实起至关重要的作用
 

基本信息

【物种】水稻

【发表期刊】Plant Journal

【影响因子】 5.726

【运用技术】基因组学、GC-MS非靶向代谢组学（由鹿明生物提供技术）

文章摘要

本文由鹿明生物合作客户中科院遗传与发育研究所程祝宽课题组发表文章，在研究中作者通过GC-MS非靶向代谢组学发现尿素可以改善OsOAT突变体的表型。由此可推断OsOAT对于氮的再利用至关重要，并且在水稻的小花发育和结实中起关键作用。

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