技术汇聚 | 蛋白质组学 DIA技术 PRM技术蛋白代谢组学研究

发布时间： 2019-07-22 04:10 来源：上海鹿明生物科技有限公司

关键词：蛋白质组学

随着质谱仪器的不断更新换代，蛋白组学的技术也不断的革新，从最早的2-D电泳技术到基于LC-MSMS的蛋白定性；从Labelfree 技术到标记定量iTRAQ/TMT技术以及时下备受推崇的DIA/SWATH技术、PRM/MRM技术，每一次的技术革新都使得蛋白组学研究更上一阶。

关键词：蛋白标记定量技术

iTRAQ/TMT技术

当下蛋白组学研究中应用最广泛的技术是同位素标记定量（iTRAQ/TMT技术）。iTRAQ/TMT技术是利用DDA扫描模式，其扫描的方式是将一级质谱信号最强的Top 20的多肽进行二级打碎，然后进入二级质谱进行检测。其优势是二级谱图采集的肽段信息都来源于同一条多肽，有利于后续的定性分析；但是对于大样本量的组学实验，iTRAQ/TMT技术也存在一定的通量限制。在这样的需求下，DIA隆重登场。

关键词：DIA技术

DIA技术是先利用常规DDA质谱检测技术分析建立图谱库，之后采用DIA方法进行质谱数据采集，从而实现对样品中蛋白质的定性及定量，不同于传统的DDA技术，DIA技术将质谱整个全扫描范围分为若干个窗口，高速、循环地对每个窗口中的所有离子进行选择、碎裂、检测，因此可以无遗漏地获得样本中所有离子的全部碎片信息，数据利用度大大提高，缺失值更少。因此，DIA技术更适合于大样本量、复杂体系的蛋白检测。

关键词：PRM技术

蛋白验证对于蛋白组学研究来说也是一大难题，以往总是要用抗体去验证蛋白，但是由于抗体的定制难度，在非模式物种中的应用一直无法进行。那有没有一个技术不需要蛋白抗体就能验证蛋白呢？有的，PRM技术。

PRM:平行反应监测(Parallel Reaction Monitoring) 是一种基于高分辨、高精度质谱的离子监视技术，能够对目标蛋白质、目标肽段（如发生翻译后修饰的肽段）进行选择性检测，从而实现对目标蛋白质/肽段进行绝对定量，因此也被称之为基于液相色谱质谱联用技术的Western Blot（LC-MSMS based Western Blot, L-WB）。

PRM技术是基于质谱的靶向验证蛋白组学技术，完美的替代了基于抗体的Western blot、Elisa等技术。

关键词：这些方法是如何应用的？

如何应用蛋白质组学的技术来解决我们研究课题中实际存在的问题呢？这个绝对是有诀窍的，应用理论和实践相结合的方式才是解决问题最快速的方法。近期由鹿明生物主办的第32期多组学培训正在火热报名中，本期特邀长期从事蛋白组学研究的张剑博士、代谢组学专家马晨菲、资深蛋白生信专家戴文韬以及培训学员500多人的资深生信讲师等……

报名方式

（长按二维码填写报名表）

时间：

2019年8月22日至8月23日

地点：

北京，具体地点待定

注册费：

2000元/人

暑期重磅大促

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关于鹿明（www.lumingbio.com）

上海鹿明生物科技有限公司（前身：成立于2009年的上海博苑生物科技有限公司），一直专注于生命科学和生命技术领域，是国内早期开展以蛋白组和代谢组为基础的多层组学整合实验与分析的团队。经过近10年的发展沉淀，公司建立起了 Labelfree、iTRAQ/TMT、DIA、PRM、修饰蛋白组等蛋白组学技术平台和全谱代谢组、靶向代谢组、拟靶向代谢组、脂质组等代谢组学技术平台以及相应的数据整合分析平台，并建立了科学完整的服务流程和精细规范的操作标准。

公司拥有：

SCIEX-QTRAP-6500,

SCIEX-QTRAP-4000,

Waters Xevo G2-XS,

Thermo-TSQ-Altis,

Thermo-Obritrap-QE,

Thermo-Obritrap-QE-HF,

Aglient-GCMS-7890B/5977A,

AglientGCMS7890B/5977A（带顶空进样装置）

及云计算分析平台等大型检测设备以及完整的样品前处理系统和数据分析系统（拥有各类分析软件及数据库）。