Clin. Cancer Res. |靶向蛋白质组学PRM技术在子宫内膜癌液体活检诊断中的应用

提问：什么是PRM技术？

PRM：平行反应监测(Parallel Reaction Monitoring) 是一种基于高分辨、高精度质谱的离子监视技术，能够对目标蛋白质、目标肽段（如发生翻译后修饰的肽段）进行选择性检测，从而实现对目标蛋白质/肽段进行相对或绝对定量。PRM技术是基于质谱的靶向验证蛋白组学技术，完美的替代了基于抗体的Western blot、ELISA等。PRM技术运用平行反应监测技术特异性地选择与预先设定质荷比相同的肽段离子并进行定量，可以有效排除干扰离子，提高蛋白质的定量准确性。

提问：PRM技术的优势是什么？

PRM技术较传统的Western blot、ELISA等靶向蛋白验证技术具有如下优势：

1. 克服了抗体制备难，买不到抗体的困境。  

2.PRM技术与DIA/iTRAQ/TMT技术都是基于质谱技术，对于组学的结果验证率有很大改善。 

3. 一次针对30个左右的目的蛋白进行精确靶向定量。

 PRM技术优势 
 

下面以一篇PRM蛋白组学应用实例文章，看看PRM蛋白质组学技术在子宫内膜癌研究中的具体应用~~

前言

子宫内膜癌是发生于子宫内膜的一组上皮性恶性肿瘤，好发于围绝经期和绝经后女性。子宫内膜癌是最常见的女性生殖系统肿瘤之一，每年有接近20万的新发病例，并是导致死亡的第三位常见妇科恶性肿瘤（仅次于卵巢癌和宫颈癌）。其发病与生活方式密切相关，发病率在各地区有差异，在北美和欧洲其发生率仅次于乳腺癌、肺癌、结直肠肿瘤，高居女性生殖系统癌症的首位。在我国，随着社会的发展和经济条件的改善，子宫内膜癌的发病率亦逐年升高，目前仅次于宫颈癌，居女性生殖系统恶性肿瘤的第二位。本篇为巴塞罗那自治大学Elena Martinez-Garcia作为第一作者在《Clinical Cancer Reserach》发表的靶向蛋白质组学在子宫内膜癌液体活检诊断中的应用文章，通过运用PRM蛋白质组学技术通过液体活检检测蛋白标志物的方式对子宫内膜癌得到一个更加准确的诊断方法，为临床诊断提供了非常好的候选标志物。

基本信息
 

英文标题：Targeted proteomics identifies proteomic signatures in liquid-biopsies of the endometrium to diagnose endometrial cancer and assist in the prediction of the optimal surgical treatment

中文标题：靶向蛋白质组学在子宫内膜癌液体活检诊断中的应用

材料：子宫分泌物

影响因子：9.619

发表期刊：Clin. Cancer Res.                          

主要技术：PRM蛋白质组学技术
 

研究背景
 

子宫内膜癌（EC）是第四大女性癌症，目前发病率和死亡率也在逐年上升。现行的诊断手段都是基于组织病理学，漏检率达22%，有50%病人的癌症组织分型和级别被错诊。基于这种现状，文章意图通过液体活检检测蛋白标志物的方式得到一个更加准确的诊断方法。通过LC-PRM技术对子宫吸出液体的52个蛋白含量进行测定，在EC组和对照组以及EC亚型组运用逻辑回归模型对数据进行处理，结果显示MMP9和KPYM，2蛋白组合，能够有效诊断EC AUC值为0.96，CTNB1,XPO2和CAPG，3蛋白组合，能够有效的区分各亚型，AUC值为0.99。该研究为临床诊断提供了非常好的候选标志物。

研究思路
 

实验结果
 

1. LC-PRM技术检测的51个差异蛋白
 

2.LC-PRM技术含量测定
 

3.ROC曲线
 

4.逻辑回归模型
 

5.LC-PRM与ELISA相关性分析
 

小鹿推荐
 

文章是典型的靶向蛋白质组研究案例。在研究分子标志物领域，PRM（靶向蛋白质组学技术）有着非常好应用前景，因为稳定性，灵敏度和通量高等特点，PRM正慢慢成为第一选择。文中就检测候选蛋白数达52种，受检病例达116例（最终确定分子标志物所需的病例数需要更多），常规方法耗时耗力，数据质量不一定高。文章思路清晰简单：PRM靶向定量--Elisa确证--数据分析--确定特征性蛋白质组合。大样本配合现行主流技术再加上有效的临床效果使得文章能够得到高分。

众所周知，目前蛋白组学检测技术发展迅速，不仅iTRAQ/TMT技术能够对蛋白质进行定量检测，DIA作为蛋白组学新一代技术以及Nature Methods 关注技术，也越来越受蛋白组学研究科研者的青睐。   

上海鹿明生物科技有限公司，一直专注于生命科学和生命技术领域，是国内早期开展以蛋白组和代谢组为基础的多层组学整合实验与分析的团队。

鹿明生物自2017年初建立了DIA、PRM等蛋白组学技术平台，是国内早期开展DIA/PRM技术服务的领跑者；近2余年来，鹿明生物积累了丰富的DIA、PRM蛋白组学等组学项目经验，公司采用高端精密的仪器设备Thermo QE-HF，SCIEX-QTRAP-6500 plus等，迄今为止，鹿明生物已处理DIA+PRM项目样品3000+例，拥有丰富完善的项目经验；目前鹿明生物也已经自主研发了大容量水稻DIA数据库及深度水稻磷酸化DIA数据库，希望能够为您的科研助力添彩；目前鹿明生物也推出蛋白组学检测+验证一体化--1+1>2的蛋白组学黄金组合服务:DIA +PRM技术。

目前针对微量样本，鹿明生物也推出了PCT-DIA蛋白组学技术，具体详情请见如下介绍：
 

参考文献

Elena Martinez-Garcia . et al., Targeted proteomics identifies proteomic signatures in liquid-biopsies of the endometrium to diagnose endometrial cancer and assist in the prediction of the optimal surgical treatment. 2017, Clin. Cancer Res.

END