修饰蛋白质组学

Modified proteomics

翻译后修饰是指由于共价键作用或者某些酶的催化，蛋白质在侧链或者某些位点发生的基团修饰，这些修饰可以发生在mRNA的翻译过程中，而且可以使得蛋白质具备相应的功能。蛋白质翻译后修饰主要包括乙酰化、磷酸化、泛素化等，它们在细胞信号转导等生物过程中起到非常重要的作用。

产品介绍

乙酰化修饰 

氨基酸的乙酰化修饰是一种可逆的在真核细胞和原核细胞中都能表达的翻译后修饰过程。乙酰化修饰的重要作用，包括DNA-蛋白质相互作用、亚细胞定位、转录活性、蛋白质稳定性等等。

技术的特点

鹿明生物通过质谱技术和富集处理，乙酰化修饰蛋白定性定量，修饰肽段的修饰位点进行大通量的检测。

实验流程

分析内容

样本要求

送样要求 

收集细胞（尽量避免使用胰酶），干冰运输；蛋白样本干冰运输

仪器设备

Thermo Orbitrap Fusion

Sciex Triple TOF 6600质谱仪

实例分析

通过乙酰化修饰组分析鉴定玉米中真菌诱导的蛋白质超乙酰化现象

基本信息
材料：玉米组织                                                                                 主要技术：iTRAQ、乙酰化蛋白组
期刊    PNAS                                                                                    影响因子：9.504

文章摘要
赖氨酸乙酰化作为一种关键的翻译后修饰参与调节一系列生物学过程。组蛋白乙酰化在植物防御中发挥了重要作用，已知编码乙酰转移酶的病原效应蛋白可以直接乙酰化宿主蛋白从而改变宿主免疫力。然而，目前还未知内源性植物酶在免疫应答过程中是否可以调节蛋白乙酰化。本篇文章中研究团队调查效应分子HC-毒素（HCT），真菌病原菌Cochliobolus carbonum家族的组蛋白脱乙酰酶抑制剂如何通过改变蛋白质乙酰化促进玉米感染效应。通过蛋白质谱方法法团队全面量化了3,636种蛋白质的丰度与HCT处理的玉米植物中2,791个位点的乙酰化水平。这些数据的分析表明，乙酰化是一种广泛的翻译后修饰且影响众多的玉米基因编码的蛋白质。此外， HCT的应用能够证明植物编码的酶（组蛋白脱乙酰酶）的活性可以被调节以改变免疫应答过程中非组蛋白的乙酰化。因此，数据结果为进一步的通过可逆乙酰化对蛋白质功能的调节，并探究由炭疽杆菌触发的复杂免疫反应提供了研究基础。

方法流程

小鹿点评
本文是修饰蛋白质组学研究的一个典型案例。不同于常规修饰蛋白质组学的研究文章着重于对位点/肽段水平的修饰进行鉴定，本篇文章在常规肽段富集技术的基础上引入了iTRAQ标记定量蛋白组技术，从而在肽段水平实现了修饰定量，为在不同处理条件下乙酰修饰组的定量比较奠定了研究基础。

文献来源
Justin W. Walley. et al., Fungal-induced protein hyperacetylation in maize identified by acetylome profiling. 2017. PNAS.

iTRAQ蛋白质组学：iTRAQ（isobaric tags for relative and absolute quantitation）技术是由美国应用生物系统公司AB研发的一种多肽体外标记技术。该技术采用4种或8种同位素的标签，通过特异性标记多肽的氨基基团，然后进行串联质谱分析，可同时比较4种或8种不同样品中蛋白质的相对含量。

蛋白质组学：v从表层原因层面探究和解决生物学问题.

一、服务须知                                                     
1.技术服务内容
本公司只提供组学技术服务。页面展示价格为市面上同类商品的参考价格，服务价格下单前请致电咨询

2.服务项目
蛋白组学，代谢组学，脂质组学，多层组学；本公司专注于多层组学定制服务；

二、公司简介                                                        

上海鹿明生物科技有限公司（前身：成立于2009年的上海博苑生物科技有限公司），一直专注于生命科学和生命技术领域，是国内早期开展以蛋白组和代谢组为基础的多层组学整合实验与分析的团队。经过近10年的发展沉淀，公司建立起了 Labelfree、iTRAQ/TMT、DIA、PRM、修饰蛋白组等蛋白组学技术平台和全谱代谢组、靶向代谢组、拟靶向代谢组、脂质组等代谢组学技术平台以及相应的数据整合分析平台，并建立了科学完整的服务流程和精细规范的操作标准。

三、业务介绍                                                      

四、仪器介绍                                                        


五、研究方向                                                         

生物领域各个研究方面，如：

▶ 农林领域：抗逆胁迫机制，生长发育机制，育种保护研究等；

▶ 畜牧业：肉类及乳品质研究，致病机理研究等；

▶ 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等；

▶ 生物医药：药物作用机理，药效评价，药物开发等；

▶ 微生物领域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等；

▶ 海洋水产：渔业资源，海水养殖，渔业环境与水产品安全等；

▶ 生物能源、环境科学领域：发酵过程优化，生物燃料生产，环境危定风险评估研究等；

▶ 食品营养：食品储藏及加工条件优化，食品组分及品质鉴定，功能性食品开发，食品安全监检测等。

六、合作流程                                                         

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注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途