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Meta-Barcoding(eDNA)技术研究

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参考报价: 面议 型号: Meta-Barcoding(eDNA)技术研究
品牌: 凌恩生物 产地: 上海
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AI问答
可以做哪些实验,检测什么? 可以用哪些耗材和试剂?

在生物多样性和环境保护相关研究中,需要对生物多样性进行有效的测量,以发现问题所在并对保护措施的有效性进行检测。基于二代测序的高通量宏条形码(Meta-Barcoding)技术,则针对既往研究中采样费时费力、鉴定鉴定准确性的瓶颈问题提供了高效有利的技术解决方案。Meta-Barcoding技术,可以从环境样本中收集总DNA,利用基因组特定基因的DNA序列,基于高通量测序技术对环境中存在的物种进行鉴定,目前已广泛用于快快速物种鉴别。

Meta-Barcoding技术的原理是:选用细胞核或细胞器基因组特定基因上、短的DNA序列,进行针对性的扩增和测序,基于数据库序列比对获得物种的鉴定信息。该技术是在不同环境中鉴定物种种类和群落结构的重要研究方法。


技术流程

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分析流程


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样本要求

样品类型1:环境样本(请使用干冰或者冰袋运送)

1)土壤≧5g;

2)水体样本,0.22µm的滤膜过滤后,送滤膜3-5张,-80℃保存,干冰运输。

样品类型2:DNA样品(请使用干冰或者冰袋运送)

1)DNA总量≧150ng;浓度≧5ng/ul。


分析示例

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OTU venn图(花瓣图)



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多样本物种组分柱状图


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聚类树与组分图结合分析



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样本间距离计算(heatmap和箱式图)


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3D-PCA分析


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