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UMI-RNA-seq技术

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参考报价: 面议 型号: UMI-RNA-seq技术
品牌: 凌恩生物 产地: 上海
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AI问答
可以做哪些实验,检测什么? 可以用哪些耗材和试剂?

UMI (Unique molecularidentifier)——特异性分子标签(UMI)为 8-10nt 的短序列,可看做“条形码”,在文库构建时通过连接接头引入UMI标签连接到cDNA分子中,标记原始样品中的每个分子,对同一来源扩增产物进行追踪和最终提取分组,用于排除 PCR 扩增偏好性和测序偏好性引入的定量偏差,便于获得足够的读数以进行分析。

UMI-RNA-seq技术是利用高通量测序技术在文库构建时引入特异性分子标签UMI,全面快速地获取某一物种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本,实现精准定量,更准确识别SNP位点(Single Nucleotide Polymorphisms),准确定量低丰度转录本,提供全面的转录组信息。

可开展真核有参转录组,真核无参转录组及原核转录组等方向研究,全面助力基因表达水平研究。


原理及优势

基因表达定量更准确

UMI技术无需跟踪拷贝数,可达到区分来自单个分子冗余的PCR重复序列,减少重复定量,屏蔽PCR偏好性,矫正测序错误,以达到绝对定量;

低丰度转录本准确定量

相同UMI标记的reads可进行相互矫正,对于测定的reads均会保留,而不会被当作背景噪音剔除,相比常规建库方式得到的有效数据量增多,可将部分低丰度转录本准确鉴定到;

获得的位点突变SNP更为准确

UMI技术降低了文库构建过程中的扩增及测序错误引入的假阳性,在进行SNP、 Indel的分析中获得的信息更为准确;

差异基因与qPCR验证一致性更高

通过UMI技术可实现精准定量,进而对于差异基因进行qPCR验证结果的一致性要明显高于普通转录组;

起始量低

对于UMI技术的建库起始RNA量低至200ng;

技术流程及送样要求

参见转录组测序流程及要求
真核有参转录组    
真核无参转录组
原核链特异性转录组


产品介绍
转录组测序RNA-seq,无疑是研究时空异质性的基因表达的利器。用了那么多年的RNA-seq,你的转录组结果真的精准吗?凌恩生物推出转录组测序新品UMI-RNAseq,给你的RNA一个UMI,转录组定量更精准!
UMI-Unique Molecular Identifier,即单分子标签。顾名思义,在转录组文库构建时,引入特异性分子标签UMI,给每个单分子带上一个特有的标签,之后无论是PCR还是测序文库构建上机,这些标签都会跟核酸片段的单分子一起被复制。测序数据中,可以通过UMI实现真正的序列多拷贝和假性(PCR偏好或其他因素造成)多拷贝的区分。通过UMI进行定量统计,结果自然更精准!UMI-RNAseq结合高通量测序,研究某物种某组织在特定时空状态下的基因表达信息,实现序列和定量的高精准要求。

技术原理
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UMI定量RNA-seq:图中的圆形彩色小球代表的就是表现出色的UMI-adaptors了。从上图不难看出,既往基于序列数进行定量,在采用了UMI标记之后,根据UMI的种类定量,可以精确的区分扩增造成的多拷贝和真实的自然多拷贝。1:3:4的最终定量结果与真实值保持一致
UMI序列校正:除了定量,UMI标签还能帮助我们实现“超强纠错”功能——给每个RNA片段配备一个与众不同的UMI的标签,通过扩增产生的多个拷贝在测序数据水平进行比对,可以检测出扩增和测序过程引入的错误。如此一来,更精准的序列获取可以帮助您实现更多的转录组研究功能!!

技术特色

  • UMI标记技术:高度链特异性标签,保留序列“真重复”,真实反映转录本表达丰度!实现无偏向的精准定量。

  • 多拷贝UMI,通过序列间比对,纠正PCR及测序过程造成的误差,获得全真转录本序列!

  • 低拷贝序列定量更准确。


送样要求
样本类型:细胞,组织,全血,血清,血浆,总RNA等
研究对象:真核,原核生物 mRNA ,  smallRNA
Total RNA起始量:1µg, 浓度≥50ng/µl

应用领域
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UMI-RNA-seq技术信息由上海凌恩生物科技有限公司为您提供,如您想了解更多关于UMI-RNA-seq技术报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。

注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途

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