人类全基因组SNP芯片

Illumina的Infinium技术无需PCR反应，不依赖限制性内切酶，在SNP位点的选择上可以完全根据基因组情况来选择，芯片反应通过等位基因特异性延伸来完成，保证了高质量的实验数据。Infinium技术既可用于全基因组分型芯片，又可以提供订制服务，根据客户选择的位点设计iSelect芯片。

1.独特的位点选择和设计，采用全世界公认的HAPMAP数据库中已经公布的TagSNP设计，具有无可比拟的全覆盖优势。
2.高重复性和特异性
3.超高通量的密度
4.超高的成功率和准确性

全基因组分型芯片是一种广谱的疾病研究工具。Illumina全基因组芯片根据SNP位点数的不同提供不同型号的芯片。列表如下：

Infinium HD BeadChips	Samples per BeadChip	Markers per Sample	MAF范围	芯片用途
HumanOmni2.5-Quad	4	~ 2.5 million	>1%	GWAS/CNV
HumanOmni1S-8	8	~ 1.25 million	>2.5%	GWAS/CNV
HumanOmni1-Quad	4	> 1 million	>5%	GWAS/CNV
Human1M-Duo	2	> 1 million	>5%	GWAS/CNV
HumanOmniExpress	12	> 733,200	>5%	GWAS/CNV
Human660W-Quad	4	> 658,000	>5%	GWAS/CNV
HumanCytoSNP-12	12	~ 300,000	-	Linkage，GWAS/CNV
Semi-Custom Human1M-Duo+	2	standard content and up to 60,800 customized SNPs per sample	-
HumanLinkage-24	24	~ 6,000 tagsnp	-	linkage
HumanLinkage V Panel Set	24	>6000	-	linkage
Mouse LD Linkage	12/32	zei适合N2和F2 小鼠株系，对于其它任何株系或杂交系有平均85%的覆盖度。377个位点，基因组中每27Mb约有4个SNPs，并均匀覆盖了整个基因组。	-	QTL研究
MouseMD Linkage Beadchip	12/32	包含1449个位点信息的引物组（OPA），主要在10种zei常用的小鼠纯株系基因组总挑选出来的，1449个位点，密度为5Mb大约3个SNP，并均匀覆盖了小鼠的整个基因组.

高通量-iSelect订制芯片：

1.高通量Infinium检测技术

2.任意物种、任意位点随意组合

3.结果可靠、成功率高

可使用3,072到1,000,000预计微珠种类针对不同位点进行设计，并且有24样本（3,072到90,000 预计微珠种类），12样本（90,001到250,000预计微珠种类）和4个样本（250,001到1,000,000预计微珠种类）三种形式的芯片提供。Infinium HD可以确保行业zei高的检出率，并且除了SNP外，还可以针对拷贝数变异（CNV）进行设计。iSelect的灵活性结合Infinium技术的高通量，可以帮助您实现对任何物种任何多态性位点的高通量研究的需要。

中低通量-GoldenGate订制芯片技术原理：

1.低成本的中等通量基因分型解决方案

2.方法经典可靠，为HapMap计划主要应用平台

3.订制灵活

Illumina专利的GoldenGate技术是理想的中等通量基因分型检测的解决方案。它可以在单管内实现zei高1536重的多重分析检测，实验成功率>99%。GoldenGate技术经典可靠，为HapMap计划所广泛采用的技术平台。GoldenGate既可以在iScan和HiScan平台上使用，也可以在BeadXpress, 平台上使用。在iScan和HiScan平台上可以实现96、384、1536或3072重的检测，在BeadXpress平台上可以实现48、96、144、192或384重的多重检测。您只需提供位点信息，Illumina即可为您进行实验设计及成功率评分，非常适合位点数从几十到几千的中等通量基因分型研究。

 

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